ID:dsi_6704 |
Coordinate:3r:14594505-14594654 - |
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Type:Unknown |
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intergenic
No Repeatable elements found
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| ...............................................................TGACGGCGAGGGGACCC.......................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .CTGCCATCGACTCGGGG........................................................................................................................................................................................................................................ | 17 | 2 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
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|
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**************************************************.(((((((.........(((..(((........)))...)))....(((((((...........)))))))..))))...))).........(((...(((((..((((.((((((..........)))))).))))...))))))))..************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
O002 Head |
M053 female body |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
SRR902009 testis |
M024 male body |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ........................................................CGTGGATACTGCCGCTCT................................................................................................................................................................................ | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| Species | Coordinate | ID | Alignment |
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| dm3 | chr3R:6482256-6482493 + | TCG-GCCA----------------TCGAATCGGGGATCAATTGCCCATGG------------GCTGGGCCGCCTTTAATGTGAGAGCACCTATGACGG----------------------------------C--------G------------AGAGACCCCCAACTC-CA-------------A------------------------AC---CACA-CCAGA-A--------------AGTATCTCCAGCTCAAATCAATCTTATCAGGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAACG----------TGTGCGTGTATGGTTCTAAACAATCCGAACCGCACATA------CAA--------------------------CACGGCCGTCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCCA---- | |
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| droEug1 | scf7180000409797:73861-74131 + | TTG------------------------AATCATGGATCGATTGCCTACGG------------GCTGGGCCGCCTTTAATGTG--AGCACCTATGACGCTTTTTGTACGAA---------------------TC--------G------A--TGGAGAGTGCCCCAACCC-CA-------------ACACCATACC---CTATGT------GCCAT-ATA-CCAGA-A--------------AGTATCTCCAGCTCAAATCAATCTTATCAGGC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGT------GCTTGCGTGTGTGTGTGTGTGGTTCTAAACAATCC-AACCGCACATA------CAA--------------------------CACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCCA---- | |
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| droTak1 | scf7180000415380:1120086-1120319 - | TCG-GCTT----------------TC-------GGATCGATTGCCCACGG------------GCTGGGCCGCCTTTAATGTG--AGCACCTATGACGAT---------------------------------C--------G------------AGGGA-CCCCAACTC-CATTTCAATC--------C-----CAT-------------------ATA-CCAGA-A--------------AGTATCTGCGGCTCAAATCAATCTTATCAGGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAATG------TGCGAGTGTGCGTGTGGTTCTAAACAATCC-AACCGCACATA------CAA--------------------------------CGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCCA---- | |
| droEle1 | scf7180000490995:246925-247123 - | TGG-TGC------------------------TGGGGCTGGT-G--CTGGG------------GCTGGGCCGCCTTTAATGTG--AGCACCTATGAGGCTATTA---GGAA---------------------TCAG-AGACCG------------AGAG---CC-------------------------------------------------------------C-A--------------AGTATCTCCAGCCCAAATCAATCTTATCAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTCTTAACAATCC-AACCGCACATA------CAA--------------------------CACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCC----- | |
| droRho1 | scf7180000778604:1412-1641 - | TCC-AATC----------------TCGATTCTCGGATCGATGGCCCACGGGCTGGGGCTGGGGCTGGGCCGCCTTTAATGTG--AGCACCTATGACGCTTTTA---CGAA---------------------TC-------------------GGAGA----CCCAACTT------------------------------------------C---CATA-CCAGA-A--------------AGTATCTGCAGCCCAAATCAATCTTATCAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTCTAAACAATCC-AACCGCACATA------CAA--------------------------CACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCC----- | |
| droFic1 | scf7180000454104:122844-123131 + | TCTTACCACGAATC---TTGGATCTCGAATCTCAGATCGATTGCCCACGG------------GCTGGGCCGCCTTTAATGTG--AGCACCTATGACGCTTTTT---T-------------------------C--------G------AGTTGGAGA---CCCCAACTC-CA-------------G-TT-----CATGT-----------------GTA-CCAGA-A--------------AGTATCTCCGGCCCAAATCAATCTTATCAGCC--AC-------GTGAAT---------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTGTGT------GTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGGTTCTAAACAATTC-AACCGCACATA------CAACACA-------------------CAACACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCC----- | |
| droKik1 | scf7180000302475:1710860-1711003 + | -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAA-A--------------AGTATCTGCAGGCCAAATCAATCTTATCAGGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGGATG------TGTGTGTGTTTGTGTGGTTCTAAACAATCC-AACCGCACATA------CAA--------------------------CACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTC------- | |
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| droBip1 | scf7180000394085:357701-357937 + | GG--GCCA----------------AGGAT---TGGATCGATTGCCAGCGG------------GCTGGG---CCTTTAATGTGCGAGCACCTATGACGCTTT-A---C-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGA-A--------------AGTATCTCCAGCTCGAATCAATCTTATCAGGGGCAC-------ACGAACCA--------------GA-------------------------------------------------------------------------------------------GA------G----TG-G--TGTG---GTGTGGTTCTG-GCACACC-AACCGCACATA------CAACAC-------AGCACACAACAGACAACACTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCCCA---- | |
| dp5 | 2:6976670-6976958 - | GTG-GCTG----------------T------------------------G------------GCAGTGCCGCCTTTAATGTG--AGCACATATGACGCTTTTA---TGGACAGGCGGCGGCGCAGCCACAGTCACCAGACCAAGATCCAGTCGTAGG----C------------------------------------------------TCCAT--CT-CCCGA-A--------------AGTATCTCGAGTTCAAATCAATCTTATCAGGG-CAC-------ACGAACCG----------------------------------------------------AAC----------------------------------------TCGCGTGTGTGTGTGT------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTCTAAACAATCC-AACCGCATACGAGCATACGT----------------------AC-GTATTGTCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCGAGATTTTCAATCAAGTC------- | |
| droPer2 | scaffold_0:832512-832792 - | GTG-GCTG----------------T------------------------G------------GCAGTGCCGCCTTTAATGTG--AGCACATATGACGCTTTTA---TGGACAGGCGGCGGCGCAGCCACAGTCCCCAGACCAAGATCCAGTCGTAGG----C------------------------------------------------TCCAT--CT-CCCGA-A--------------AGTATCTCGAGTTCAAATCAATCTTATCAGGG-CAC-------ACGAACCG----------------------------------------------------AAC----------------------------------------TCG--A--GTGTGTGT------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTCTAAACAATCC-AACCGCATACGAGCATACG---------------------------TATTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTC------- | |
| droWil2 | scf2_1100000004921:292873-293027 + | --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-A--------------TGTATCTCGAGCTCAAATCAATCTTATCGGGC--AC-------ACGAAGCT------ACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTATCTGACTGAGTGTGGTTCTAAACAATTC-AACCGCATATA------CAA--------------------------CATTGGCGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTCGAAAACG | |
| droVir3 | scaffold_13047:1472679-1472964 + | CT------------------------------GGGATCAAT-GCC-----------------GCCAGGCCGCCTTTAATGTG--CGCA--TATGACGCTTTTA---TGGACAGCCGGCA-------CACACTCAG-A-------------------G----C------------------------------------------------TCTAT--GG-C--CA-A--------------AGTATCTTTGGCTCAAATCAATCTTATCAGGC--ACTAGGCAGA------------AACGAAATTT------------AACAACAGCTACAACATGCA-AACGTTTTCGATTTTGG--------------------------------------GTGTGCGT------GTGTGAGTGTTTGTGTGTTTGGTTCTAAACAATTC-AACCGCATATA-----------------------------------CATTGCTGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCAACATTTTCAATCAAGTC------- | |
| droMoj3 | scaffold_6540:5562238-5562496 + | TCT----------------------------------------------------------------------------------------ATG--------------GC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA-A--------------CGTATCTGTGGCTCAAATCAATCTTATCACAGGCACTAGGCACA------------AACGAAACAGAACAACGGCAACAACAACAACAACAACATGCCAAACGTTTTCGATTTCGGGTAAATATATGCCTGAGTGTGCATGTGTATTCG--T--ATGTGTGT------GTGTGTGTGTGTATCTGTATGGTTCTAAACAATTC-AACCGCATATA-----------------------------------CATTGCTGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTC------- | |
| droGri2 | scaffold_14906:4762798-4763137 - | CT------------------------------GGGATCGAT-GCC-----------------GCCGGGCCGCCTTTAATGTG--CGC--ATATGACGCTTTTA---TGGACAGGCGGCA------------------------------------------CAC-ACTC-AG-------------A-GC-----CATA-GAGCT-------C---CACAGTCAGA-ATCAGTATCTGTATTTGTATCTATGGCTCAAATCAATCTTATCAGCC--AC-------A------------AAACGAAAAGAGCAGCAACAACAACAACAACAACAACATGCAAACCGTTTTCGATTTTGGATATTTCTC--------------TGTGTAGTTG--TGTGTGTGTGT------GTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGGTTCTAAACAATTC-AACCGCATACA------T-A--------------------------CATTGCTGGCTGTCACCTAAGCTATTAACCTGATTTTCTAGATTTTCAATCAAGTC------- |
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| droSim2 |
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