ID:dsi_28982 |
Coordinate:2r:7881842-7881991 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
![]() |
![]() |
three_prime_UTR [2r_7881735_7881812_-]; CDS [2r_7881813_7881841_-]; exon [2r_7881735_7881841_-]; intron [2r_7881842_7882270_-]
| Name | Class | Family | Strand |
| AT_rich | Low_complexity | Low_complexity | + |
| --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------################################################## CTTTTTACTATTCCTAAAACAATATCCGTACATATTTTCCGCCTTTTATAATTGTTTCGATCGGTGTACCAGTTTGAAAAGAAACAAATTTGTTTTAAGGTATTAGAATTAAATGTTACAATTTTTCTTGTATTAGTACACAAACCATATTTTATTTATCAACACTTAATTAATAATAATCTTTTTAATTTATTTTCCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGTGGACCCATCCTATC **************************************************.............((((((.(((..((((((......(((((((((((....)))))).))))).......))))))....))).))))))...........................................................************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
M025 embryo |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
GSM343915 embryo |
O001 Testis |
SRR902009 testis |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR902008 ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...................................................................................................................................................................................................................................AGGCATTGTGGACCCATACA... | 20 | 3 | 2 | 9.00 | 18 | 18 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................AGGCATTGTGGACCCATAC.... | 19 | 2 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................................................TGACTGGCGAGTAAGCATTGTGGACCC........ | 27 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................................................GTAAGCATTGTGGACCCATCCTAT. | 24 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGATGATGACTGGC........................... | 19 | 0 | 2 | 1.50 | 3 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGATGATGACTGGCGA......................... | 21 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................GAGTAAGCATTGTGGACCC........ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................................................................................................GATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGT.............. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................CGAGTAAGCATTGTGGACCCATCCT... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................GATGACTGGCGAGTAAGCATT................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGATGATGACTGGCG.......................... | 20 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| .................................ATTTTCCGCCTTTTATAA....................................................................................................................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................CGAGTAAGCATTGTGGACCC........ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................................................................................................GGCATTGTGGACCCATCCAA.. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................ATTTTCCGCCTTTTATAATT..................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................................GCATTGTGGACCCATAC.... | 17 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................ATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGT.............. | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................ATGGAGATGATGACTGGCGAGT....................... | 22 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................ATGAGGCATTGTGGACCCAT...... | 20 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .............................................................CGGAGTACGAGTTCGAAAAGA........................................................................................................................................................................ | 21 | 3 | 4 | 0.50 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................AGGCATTGTGGACCC........ | 15 | 1 | 4 | 0.50 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................TTCATGGAGATGATGACTGG............................ | 20 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGATGATGACTGGCGAGT....................... | 23 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................ATGGAGATGATGACTGGCGAG........................ | 21 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................ATTCATGGAGATGATGACTGGC........................... | 22 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................ATGCATTGTGGACCCATACAA.. | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TGTTTTGGGGTATTGGAATTA........................................................................................................................................... | 21 | 3 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TGTTTTGGGGTATTGGAATT............................................................................................................................................ | 20 | 3 | 20 | 0.20 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 1 |
| ........................................................................................................................ATTTTACTTGTATTAGTACCA............................................................................................................. | 21 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................TCGGAGTGCCAGTTTGAA............................................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................................GCATTGTGGACCCATACAAA. | 20 | 3 | 9 | 0.11 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGAAAACGACTGGCG.......................... | 20 | 3 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................CATGGAGATGATGAAAGG............................ | 18 | 2 | 10 | 0.10 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTGGTAGACAAACCAGATT................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................GAAGAATGGCGATTAAGCA.................. | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
|
GAAAAATGATAAGGATTTTGTTATAGGCATGTATAAAAGGCGGAAAATATTAACAAAGCTAGCCACATGGTCAAACTTTTCTTTGTTTAAACAAAATTCCATAATCTTAATTTACAATGTTAAAAAGAACATAATCATGTGTTTGGTATAAAATAAATAGTTGTGAATTAATTATTATTAGAAAAATTAAATAAAAGGTCTTAAGTACCTCTACTACTGACCGCTCATTCGTAACACCTGGGTAGGATAG
**************************************************.............((((((.(((..((((((......(((((((((((....)))))).))))).......))))))....))).))))))...........................................................************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | O002 Head |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
GSM343915 embryo |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..................................AAAAGGCGGAAAATATTA...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................TCCGTAACACCTGGGTATGTT.. | 21 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................TGATTTAATTATTTTTAGAAAATT............................................................... | 24 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| GTAAAATGATAAGGACTTTG...................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................TAAATAGTTGTGAAATAG............................................................................... | 18 | 2 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................AAATTAAATAGTTGTGAAAT................................................................................. | 20 | 2 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................CCTCATGCTCAAGCTTTTCTT....................................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ......................................................................................................................................TGATGTGCTTGGTATAA................................................................................................... | 17 | 2 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ........................................................AACTAGCCACATTGTCA................................................................................................................................................................................. | 17 | 2 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ........................................................................................................................................................ATAAATAGGAGTGAATTA................................................................................ | 18 | 2 | 15 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................TGACCGCTCATGCGTT................. | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ........................................................................................................................................................ATAAATAGTAGTGAA................................................................................... | 15 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .........................................................................................................................................................GAGATAGTTGTGAATTAGT.............................................................................. | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| droSim2 | 2r:7881792-7882041 - | dsi_28982 | CTTTT-TACTATT--------CCTAAAACAATATCCGTACATATTTT-CCGCCTTTTATAATTGTTTCGATCGGTGTACCAGTTTGA-----------------------------------------------------------------AAAGAAACAAATTTGTTTTAAGGTATTAGAATTAAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTTACAATTTT-TCTTGTATTAGTACACAAA--------------------------------------------------------------------------CCATATTTTATTTATCAACACT--TAATTAATAATAA-------------------------------TCTTTT--TAATTTATTTTCCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGTGGACCCA-TCCTATC----- |
| droSec2 | scaffold_1:4729732-4729948 - | CTTTT-TACTATT--------CCTAAAACAATATCCGTTCATATTTT-CCGCCTTTTATAATTGTTTCGAATGGTGTACCAGTTTGA-----------------------------------------------------------------AAAGAAACAAATTTGTTTTAAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGTCCAATTTC----------------------------------------------------------------------------------------------CCATATTTTAGTTATCAACACT--TAATTAATAATAT-------------------------------TCTTTT--TAATTTAATTTACAGAATTCATGGAAATGATGACTGGCGAGTAAGCTTTGTGGACCCA-TCGTATC----- | |
| dm3 | chr2R:7161598-7161842 - | CATTT-CACTATT--------CCTAAAACAAAATCCGTCCATATTTT-CCGCCTTTTATAATTGTTCCGATTGGTGTACCAGTTTAA-----------------------------------------------------------------AAAGAAACAAATTTGTATTATG--------------------------------------------------------------------------------------------AG--------------GTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGTCCAATTTCCACTTGTATTAGTACACAAA--------------------------------------------------------------------------CCATATTTTAGTTATCAACAATAATAATAATTAATAT-------------------------------TATTTT--GTATTTAATTTCCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGTGGACCCA-ACGTATC----- | |
| droEre2 | scaffold_4845:18626616-18626854 + | CTCTT-CACCACTCCC--GTTCCGAAAACAATTGACTTCCTTATTTG-CCCTCTTTTATAATTT-GGCTAGCTGTGCACCCGCTTAC--------------------------------------------------------------------------------TTTTAGGGTTTT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGCGTTGATA----------------------------------------------CCTAGTATAAT-TATACAACCCATATATCATACG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTTTAGTTTTCGCCACT--CCATTAATAATCT-------------------------------TATTTT--TAATTGAATTTTCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCGTCATGGAGCCA-TTTTTTT----- | |
| droYak3 | 2R:1978051-1978392 + | CTCTT-CAACACTCCC--ATTTCAAAACCAATTTACTTTCTCATTTT-TCGCCTTTTATAATTG-GACGATCTGTGTACCAGTATTT-------------------------------------------------A---------------ACAGACA------TTTTGTAAGGTATTAGGAT-AAATGATAGT----------------GT-------------AGTGAACTGGATTACCTTCA-----GTTCTTTTAGTATGT------------------------------------------------------------------------TGCATTAATAATAAAAGTATAATTCTGATGTATTAT-----TCGGTAGGGACCAGCCCTAGTATTAT-TATTCAACCCATAATTAGAACG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCTTTGAGTTTTTGCCACT--CAATTAATTATCT-------------------------------T-TTTC--TAATTTCATTTTCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTGTGGACCCA-TCGCATC----- | |
| droEug1 | scf7180000409462:1342862-1342955 + | TTAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CATT--CAATTAATTGTTCTACTT--------------------------AT---T--TTTATCCATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTTTGGACCCA-TCTTATC----- | |
| droBia1 | scf7180000301754:1129026-1129370 + | TAGA--CACTGATCTTATAA--TTAGAGGA-ATGATGCTTTTATTTG-TTTTAATTTCAAATATTGCTCAACTATGGATT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCATT-TGTAAAATGTATTTTATTTAAATGAATTTATTTCGTGCTTTGACTTAAAGAGGTAGGCCATAACCTGATATTTATTTCGCTTTAAAATATTGTTCATGTTGAACGTACTTATTGTATAAATA----------------------------------------------TTTAAAATATTTTGAATAGCATAGATACCTTTCGCTGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------TCAACCTTAAACTCAGCCA------TTTAATTGTTTTACTT--------------------------TCCTTT--TCCTTTTATTTTTAGAATTTATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTTTGGACCCC-TCTTATC----- | |
| droTak1 | scf7180000415313:90997-91386 + | CTATA---CCGCTCTGATAT--TTCAGATAATATGCGTTTTTATTTGTTCCTCTTTTAAAATATAGCTGATCTTTGCAAAAGTTTTC-----------------------------------------------------------------AAAGG-----------------G--------G-AAATAATACTTAAAATTTAACAATGTGTATACAATGCAATGCTTGAACTTTATTATCTTGAAACAAAT-TATTT-ATTCTCTG--------------GTTAA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACAATTTATCTCTTGAAATCTTATAAACATTTGTAAATTAGTTGGCAACAAATGTCTTTTTAGTTTGATAAATTGCTAGTATGTTTTCTAGAAGACCCTTTTTTCCTATTTTACTTTTGATCTCT--TAATTAATCATTTCACTT--------------------------TCCCAT--TCATTTCCTTTACAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCGTTTTGGACCCA-TCTTATC----- | |
| droEle1 | scf7180000491214:2606163-2606276 - | TTTATTTATTAA-GCT--TAATCGAT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT--TAATTAATTGTTCAACTT--------------------------TCCCAT--CCGTTTCATTCACAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCATTTTGGACCCA-TCCTATC----- | |
| droRho1 | scf7180000777365:17612-17687 + | AAAATAC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTT--TAGTTAAAAATGATTCAA--------------------------TA---CATTTTTTGAATTTATAGAATTCATGGAAGTAATGACTGGTG-------------------------------- | |
| droFic1 | scf7180000453773:104083-104290 - | TTAACTT-ATATAGGT--TTTTGGACTTTAGTTTATTTCT-----------TCGTATGTAATTTTTGTGAAAGGTTTTTAATAATAA-----------------------------------------------------------------CAATACAAAGTATT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTACAATTGT----------------------------------------------------------------------------------------------ATATGCCTTAGTTCTGGTCACT--TTATTAATGATATTTCCT--------------------------CCCATT--CAATTAATTTTACAGAATTCATGGAGATGATGACTGGAGAATAAGCGTTCTGGACCCA-ACTTGTC----- | |
| droKik1 | scf7180000302682:8362-8464 + | TATTCTT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATAACT--CAACTAATTACTCCACTT--------------------------TT--CC--TTTTCCCTCTTGCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCCAAACCAACACA-TCGCATCAT--- | |
| droAna3 | scaffold_13266:869847-870164 - | dan_1695 | TTACA---CCAACAGGAAAT--TATTGT-AGAATAAATGTCT----------------AAATTTTTCTCTACTGATGTTT-----TTTTTTTTTGGAAATTTTAATTACTTTATTTTTATGATCTGAAAAACATTTATGACTCATAAATGGAATTGAAATTTATTCGTTTTATT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAATAAAATTATAATCATCATAAATCTTTAGTTTCGAAAAATAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAT--CATAAAATTATTTAATTTTTTATTATCCATAACTAATAAGATTTTGCCGCCATTCTTTTATTTGCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAGTAAGCGCATTGGACCCAATCTCATCCTATT |
| droBip1 | scf7180000396730:1877293-1877395 - | ATACTTTAATACC--------TTTAAAAAATAATGTTT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCCCGTTCTTCATCTATTTGCAGAATTCATGGAAATGATGACTGGCGAGTAAGCGTATTGGACCCA-TCTCATC----- | |
| dp5 | XR_group6:13173781-13173829 + | TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGTTTAATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACCGGCGAGTAAATA------------------------ | |
| droPer2 | scaffold_88:212195-212256 + | TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGTTTAATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACCGGCGAGTAAAT-----AGACGCA-CTGCGTC----- | |
| droWil2 | scf2_1100000004513:468347-468398 - | AACC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATT--TTATTTCA-TTTCAGAATTCATGGAGATGATGACTGGCGAATAAAC------------------------- | |
| droVir3 | scaffold_10324:356323-356377 - | AAATT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCT--TTCTTTCATTTACAGAATTCATGGAAATGATGACGGGCGAATAAGCA------------------------ | |
| droMoj3 | scaffold_6680:3461538-3461606 - | CGTTT-AA-------------------ATAATGT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CT--------------------------GTCATT--TTGTTTAACTTACAGAATTCATGGAGATGATGACCGGCGAGTAAATA------------------------ | |
| droGri2 | scaffold_15110:9884731-9884844 + | TTACATATATTTT--------TTTATAAA--------------------TGCATATTACGATCGTTTTGA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CATT--CGATTTTTAATGT---CT--------------------------GTCATT--CTGTTTAATTTACAGAATTCATGGAGATGATGACCGGCGAGTAAATA------------------------ |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droSim2 |
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Generated: 05/19/2015 at 12:26 AM