ID:dsi_27726 |
Coordinate:2r:21325209-21325270 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
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| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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exon [2r_21325271_21325995_-]; CDS [2r_21325271_21325882_-]; exon [2r_21324806_21325208_-]; CDS [2r_21324806_21325208_-]; intron [2r_21325209_21325270_-]
No Repeatable elements found
| ##################################################--------------------------------------------------------------################################################## CGCTCTCCAGGATCTCGAACATAAGACCCAACGTCGCTGTTCTATACAACGTAAGTCCCTGGTCTATCCTGAAGACTTCCTTGTTGGTTCCCCGCTAAGATTTTTCCCACAGGCTCTCAAGGAGAAGGAAGAGGTTTACACGGTCAACATCGGCCCTAAGCG **************************************************........((.((.......(((((....((((.(((....))).))))..)))))..))))************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M023 head |
M024 male body |
SRR902009 testis |
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| ....CTCCAGGATCTCGAACAT............................................................................................................................................ | 18 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .......................................................TACCTGGTCGATCCTG........................................................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 |
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| ..CGCTCCAGGATCTGGAACC............................................................................................................................................. | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...............................................................................................TAAGAGTCTTCCCACA................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
|
GCGAGAGGTCCTAGAGCTTGTATTCTGGGTTGCAGCGACAAGATATGTTGCATTCAGGGACCAGATAGGACTTCTGAAGGAACAACCAAGGGGCGATTCTAAAAAGGGTGTCCGAGAGTTCCTCTTCCTTCTCCAAATGTGCCAGTTGTAGCCGGGATTCGC
**************************************************........((.((.......(((((....((((.(((....))).))))..)))))..))))************************************************** |
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M024 male body |
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SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
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SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
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| .CGAGAGGTCCTAGAGCTTGTAT........................................................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| droWil2 | scf2_1100000004512:1513565-1513723 - | TGATGTCCAAGTT------TCTAACACTTACGTCCAATTGCGGCCTGCTGCACAATGTAAGTACTCAATT--GTGCCACAAAATAGTCAAAT----------ATT----------------------------------------------CTCTAGATCGAT----------------TTGTTTATAGGCCCTCAAGGAAAAGGAAGAGGTCTATACGGTGAATATTGGTCCTGAAAG | |
| droVir3 | scaffold_12875:17195806-17195978 + | dvi_7429 | CCATCGGCAAGGT------GATACAGCTGGACACCAACTGTGGCACGCTCTTCAATGTGAGTAGTGCGGG--CGAGCGAAAGCTCCATAAAG----------ATTC-TCTCCATAAACTCT--C--------C------TTG-------GCCC---------T---------------ATTTCGCACAGGCACTCAAGGAGAAGGAGGAGGTGTACACGGTGAATATTGGACCCGAGCC |
| droMoj3 | scaffold_6496:10810448-10810604 - | TTTTTGGCAAAAT------GTTGCCGCTGGCCACCAACTGTGGCACGCTCTACAATGTGAGTGGTTTGATCCGAG------T--------------------ATT---C-----------------------C------TAGTATCTAGCTTACACCTCA------------------TCCTTTGGCAGGCTCTCAAGGAGAAGGAGGAGATCTACACGGTGAACATTGGCACTGAGGT | |
| droGri2 | scaffold_15245:16715442-16715607 + | TGCTCAGCAGTGT------GATGCCGCTAGACACCAACTGTGGCCTGCTCTTCAATGTGAGTAAATCGAA--CTG---------------------------AT-TCGC---------TTG--GTTGGGTTGCCTAAACAAA-------ACAC---AAAATT----------------CATTTTAACAGGCGCTCAAGAAGAGGAAGGAGGTTTATAAGGTGAATATAGGAACGGAGCA |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| droSim2 |
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| droSec2 |
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| dm3 |
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| droEre2 |
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| droYak3 |
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| droEug1 |
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| droBia1 |
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| droTak1 |
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