ID:dsi_2670 |
Coordinate:x:3104972-3105043 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
| -18.4 |
![]() |
intergenic
No Repeatable elements found
|
GCATTCAGCTTCAATGGAACCAGATCAGGAGATATACAGCCAGCCGGGTAGTAGAATCAGGCCAGCAGAAGGTTATCAAGCGGCAATGCAACACGCCCTTGTCCTTGATATTCATGATTCAGATCATACGGAGACGCGTGGCAGCGGCGGATCGAATCCCTTTCCGCAGGAC
**************************************************...((..((..............(((((((.(((((.((.....))..))))))))))))....))..))..************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR902009 testis |
O001 Testis |
M024 male body |
SRR1275487 Male larvae |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
M023 head |
SRR902008 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAG........................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 56.00 | 56 | 56 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCA............................................................................................................ | 20 | 1 | 1 | 29.00 | 29 | 29 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGACG.................................... | 20 | 1 | 1 | 13.00 | 13 | 13 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGTT......................................................................................................... | 23 | 3 | 1 | 9.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCC............................................................................................................. | 19 | 1 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAT........................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGAC..................................... | 21 | 1 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGAC..................................... | 19 | 1 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGT.......................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................ATGATTCAGATCATGCGGAG....................................... | 20 | 1 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGAA..................................... | 19 | 2 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................GTAGTAGAAGCAGGCCAGCAG........................................................................................................ | 21 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................TTCAGATCATGCGGAGACG.................................... | 19 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................GGTTATCAAGCGGCAATGTA.................................................................................. | 20 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............AATGGAACCAGATCAGGAGAT........................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAAGCAGGCCAGCAGA....................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGA...................................... | 20 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................CCAGCCGGGTAGTAGAAGCATA............................................................................................................... | 22 | 3 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CAGCCGGGTAGTAGAAGCAGGC.............................................................................................................. | 22 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCATT.......................................................................................................... | 22 | 3 | 2 | 3.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........TTCAATGGAACCAGATCAGGAG............................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................CGTGGCAGCGGCGGATCGAATT.............. | 22 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAATCAGGCCAGCAGAA...................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................GTAGTAGAAGCAGGCCAGCAGT....................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................ACGCGTGGCAGCGGCGGATCGTT................ | 23 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CAGCCGGGTAGTAGAAGCAGGT.............................................................................................................. | 22 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............AATGGAACCAGATCAGGAGA............................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGC.......................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........TCAATGGAACCAGATCAGGAG............................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................CCGGGTAGTAGAAGCAGGCCT............................................................................................................ | 21 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCT............................................................................................................ | 20 | 2 | 2 | 2.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAG....................................... | 19 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGTA......................................................................................................... | 23 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCTT........................................................................................................... | 21 | 3 | 4 | 1.50 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCT............................................................................................................. | 19 | 2 | 2 | 1.50 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAAGCAGGCCAGCATT....................................................................................................... | 21 | 3 | 2 | 1.50 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................AATGCAACACGCCCTTGTCCTTG................................................................. | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................GGCAGCGGCGGATCGAATTT............. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................ATGATTCAGATCATGCGGATAA..................................... | 22 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAAGCAGGCCAGCAGAATT.................................................................................................... | 23 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................CGTGGCAGCGGCGGATCGAA................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................CCGGGTAGTAGAAGCAGGCCA............................................................................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAA........................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................TATTGCCAGCCGGGTAGTAGA..................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCTAT........................................................................................................... | 21 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................CAGCGGCGGATCGAATCCCTTT......... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................ACCAGAGAAGGAGATATACA...................................................................................................................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................GTAGTAGAATCAGGCCAGCA......................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................CAACACGCCCTTGTCCTTGA................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................GGTAGTAGAAGCAGGCCAG........................................................................................................... | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAAGCAGGCCAGCAG........................................................................................................ | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TGCAACACGCCCTTGTCCTTG................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................CAGGAGATATACAGCCAGCC............................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........CAATGGAACCAGATCAGGAG............................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................AGCCGGGTAGTAGAAGCAGGCT............................................................................................................. | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAAGCAGGCCAGCAGAT...................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAAGCAGGCCAGCAGAA...................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CAGCCGGGTAGTAGAAGCAGGA.............................................................................................................. | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................CAGGATAGCAGAAGCTTATCA.............................................................................................. | 21 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................GGCAGCGGCGGATCGAATCCCT........... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGCT......................................................................................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................ATATTGCCAGCCGGGTAGTAG...................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................CGTGGCAGCGGCGGATCGAAT............... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................GTAGTAGAAGCAGGCCAGCA......................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGACGT................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGAA..................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................TCCTTGATATTCATGATTC.................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................CGCGTGGCAGCGGCGGATCGA................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................GGAGACGCGTGGCAGCGGCGG...................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................GCCGGGTAGTAGAAGCAGGCC............................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................CCAGCCGGGTAGTAGAAGCAGG............................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................ATGATTCAGATCATGCGGAGA...................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................TCAGATCATGCGGAGACGTTT................................. | 21 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................GAAGGTTATCAAGCGGCAATG.................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGACA.................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................GCCGGGTAGTAGAAGCAGGCCT............................................................................................................ | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..ATTCAGCTTCAATGGAACCAG..................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGACT.................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGCCAGA.......................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................GCCGGGTAGTAGAAGCAGG............................................................................................................... | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGTCCA............................................................................................................ | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............TGGAACCAGATCAGGAGAT........................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAATCAGGCCAGCA......................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............ATGGAACCAGATCAGGAGAT........................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................CATGATTCAGATCATACGGA........................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................TACAGCCAGCCGGGTAGTAG...................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGACGC................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGAATCAGGCCAGCAGAA...................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................AGATATACAGCCAGCCGG............................................................................................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................AGCCGGGTAGTAGAAGCAGG............................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTTAGATCATGCGGAGACG.................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................GATTCAGATCATGCGGAGACG.................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGACG.................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CAGCCGGGTAGTAGAAGCAT................................................................................................................ | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................TTCAGATCATGCGGAGACGCG.................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................GTAGAAGCAGGCCAGCAGAA...................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................AAGGTTATCAAGCGGCAA...................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................TATACAGCCAGCCGGGTAG......................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................AGCGGCAATGCAACACGCCCTTG....................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................GCGGCAATGCAACACGCCCTTT....................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................CCAGCCGGGTAGTAGAAGCAT................................................................................................................ | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............ATGGAACCAGATCAGGAGATAA......................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GAGATATATTGCCAGCCGGG............................................................................................................................ | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CAGCCGGGTAGTAGAAGCAGGCC............................................................................................................. | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................CCGGGTAGTAGAAGCAGGCC............................................................................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................TCAGATCATGCGGAGACGTT.................................. | 20 | 3 | 5 | 0.80 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGAAGTAGAAGCAGGCCAG........................................................................................................... | 21 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................CGGAGACGCGTGGCAGCGGCTTT..................... | 23 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGTAGTAGAAGCAGGC.............................................................................................................. | 18 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGTT..................................... | 21 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................GTCGGGTAGTAGAATCAGC............................................................................................................... | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................AGATATATTGCCAGCCGGGTT.......................................................................................................................... | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GAGATATATTGCCAGCCGG............................................................................................................................. | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................AGAAGGTTATCAAGCGGTT....................................................................................... | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................CCGGGTAGTAGAAGCAGGTT............................................................................................................. | 20 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TAGTAGTATCAGGTGAGCAG........................................................................................................ | 20 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAAGCAGGCCAGCAGATT..................................................................................................... | 22 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGGGAAGTAGAAGCAGGCCAT........................................................................................................... | 21 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAAGCAGGCCAGCAGTT...................................................................................................... | 21 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................TGATTCAGATCATGCGGAGTA..................................... | 21 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................GGTTATCGAGCGGCAATGAC.................................................................................. | 20 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................AGCCGGGTAGTAGAAGCAGTT.............................................................................................................. | 21 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGCGGCGGGTAGAATCCTT........... | 19 | 3 | 10 | 0.20 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGAAT.................................... | 20 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................AGTAGAAGCAGGCCAGCATT....................................................................................................... | 20 | 3 | 10 | 0.10 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................AGCGGCGGGTAGAATCCT............ | 18 | 3 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 |
| ....................................................................................................................ATTCAGATCATGCGGAGAAA.................................... | 20 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................ACAGCCAGCCGGGAA.......................................................................................................................... | 15 | 1 | 16 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..............TGGGACCAAATCAGGAG............................................................................................................................................. | 17 | 2 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
|
CGTAAGTCGAAGTTACCTTGGTCTAGTCCTCTATATGTCGGTCGGCCCATCATCTTAGTCCGGTCGTCTTCCAATAGTTCGCCGTTACGTTGTGCGGGAACAGGAACTATAAGTACTAAGTCTAGTATGCCTCTGCGCACCGTCGCCGCCTAGCTTAGGGAAAGGCGTCCTG
**************************************************...((..((..............(((((((.(((((.((.....))..))))))))))))....))..))..************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR902009 testis |
O001 Testis |
M024 male body |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................................................................................TTGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 21 | 0 | 1 | 47.00 | 47 | 47 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 19 | 0 | 1 | 35.00 | 35 | 35 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 20 | 0 | 1 | 30.00 | 30 | 30 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................TACGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 21 | 0 | 1 | 29.00 | 29 | 29 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 22 | 1 | 1 | 21.00 | 21 | 21 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 21 | 0 | 1 | 20.00 | 20 | 20 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TTTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 1 | 1 | 19.00 | 19 | 19 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 20 | 1 | 1 | 19.00 | 19 | 19 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 21 | 0 | 1 | 12.00 | 12 | 12 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...AAGTCGAAGTTACCTTGGTCT.................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 11.00 | 11 | 11 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................GCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 21 | 0 | 1 | 10.00 | 10 | 10 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TTTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 20 | 1 | 1 | 10.00 | 10 | 10 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 20 | 0 | 1 | 9.00 | 9 | 9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GTTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 21 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 19 | 1 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 22 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 21 | 1 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 19 | 2 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 20 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................AACGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 21 | 1 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 20 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 22 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 18 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................CGTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTTTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 22 | 1 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................ACGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 20 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................ATGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 19 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................ATTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 21 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 19 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....AGTCGAAGTTACCTTGGTCT.................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................GGGAACAGGAACTATAAGTAC........................................................ | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................GTTACGTTGTGCGGGAACAG..................................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................GGGAACAGGAACTATAAGTA......................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 20 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TGAACAGGAACTATAAGTACTA...................................................... | 22 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................GCCCATCATCTTCGTCCGGT............................................................................................................ | 20 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................AACAGGAACTATAAGTACTA...................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................AATTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 20 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................GTCCGGTCGTCTTCCAATAGT.............................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................TTACGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................CTATAAGTACTAAGTCTAGTA............................................. | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TTTGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TATGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 21 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 19 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................AAGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 23 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TGTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................ATTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................CGTTACGTTGTGCGGGAAC....................................................................... | 19 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTATGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 25 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................CTCTGCGCACCGTCGCCGCCTA.................... | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTTTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 21 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................AACAGGAACTATAAGTACTAA..................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........AAGTTACCTTGGTCTAGT................................................................................................................................................. | 18 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................CGGGAACAGGAACTATAAGTA......................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTAGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 24 | 3 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTGTGCGGGAACAGGAAC................................................................. | 19 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................GGCCCATCATCTTCGTCCGGT............................................................................................................ | 21 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTTGTGCGGGAACAGGAAC................................................................. | 20 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 21 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 22 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................ATTGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 22 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................CATGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................ATTGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 23 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TTTACGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 23 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............TACCTTGGTCTAGTCCTCTA........................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................ATGCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTTGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................AATTCCAATAGTTCGCCGTTACG................................................................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................TGTCGGCCCATCATCTTCGT................................................................................................................. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................ATTTTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................GGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................TTGCCGCCTAGCTTAGGGAAAG........ | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........GTTACCTTGGTCTAGTCCTC............................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTGTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................TTTTTTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 24 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................TCCTCTATATAACGGTCGGCC............................................................................................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TATGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................TGTCCGGTCGTCTTCCAATA................................................................................................ | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................GTACTAAGTCTAGTATGCCTC....................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................AGTACTAAGTCTAGTATGCCT........................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................CTTCCAATAGTTCGCCGTTACG................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................ATCATCTTCGTCCGGTCGTCT....................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................AACTAAGTCTAGTACGCCTCT...................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................ACTAAGTCTAGTATGCCT........................................ | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................ATGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................AGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................TTGCTTAGGGAAAGGCGTCCT. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| CGTAAGTCGAAGTTACCTTG........................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTATAAGTACT....................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TATGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTAGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TTGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................TAGTCCGGTCGTCTTCCAA.................................................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TTTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................ATATAACGGTCGGCCCATCAT....................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................AGTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAATT................................................................ | 17 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................AGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................TTGGCCCATCATCTTCGTCCGGT............................................................................................................ | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................ATTGCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................CCGCCTAGCTTAGGGAAA......... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GTTGTGCGGGAACAGGAAC................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................CATCATCTTAGTCCGGTCGTCT....................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................CGCCGTTACGTTGTGCGGGAACAG..................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................CTATATGTCGGTCGGCCCATC......................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GTTGTGCGGGAACAGGAACTG............................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTATAAGTA......................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................ATCCTCTATATAACGGTCGGCCC............................................................................................................................ | 23 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................CCAATAGTTCGCCGTTACG................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........GTTACCTTGGTCTAGTCCTCT............................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................CTCTATATAACGGTCGGCCC............................................................................................................................ | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................TAACGGTCGGCCCATCATCTT.................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................ATGTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................ATAACGGTCGGCCCATCATC...................................................................................................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTTTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 20 | 2 | 3 | 1.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................GTCCGGTCGTCTTCCAATAG............................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................GCGCACCGTCGCCGCCTAG................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................ATGTGCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................ACGTTGTGCGGGAACAGGAAC................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................GTCTTCCAATAGTTCGCCGT....................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................GCGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................ATAACGGTCGGCCCATCATCT..................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................CAGGAACTATAAGTACTAAGT................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................ACAGGAACTATAAGTACTAA..................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TTTTCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............TACCTTGGTCTAGTCCTCT............................................................................................................................................ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................TTGTCCGGTCGTCTTCCAAT................................................................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................TATCATCTTCGTCCGGTCGTCT....................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............TACCTTGGTCTAGTCCTCTAT.......................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................ATTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 19 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................ATTTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................GTTACGTTGTGCGGGAACA...................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTTTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................CCTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................ATTAGCTTAGGGAAAGGCGTC... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................AACGTTGCGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TTTTGTGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................TGTCCGGTCGTCTTCCAATAG............................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................TATAACGGTCGGCCCATCAT....................................................................................................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................TTGGAACAGGAACTATAAGTA......................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................ATTGGTCTAGTCCTCTATATA....................................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CATCTTAGTCCGGTCGTC........................................................................................................ | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................GCGGGAACAGGAACTATA............................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................CGTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................ATTTGTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 25 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................ATCGGGAACAGGAACTATAAGT.......................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....GTCGAAGTTACCTTGGTCTA................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GTGCGGGAACAGGAACAATA............................................................. | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................CTGCGGGAACAGGAACTATAA............................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................TTGCGGGAACAGGAACTACA............................................................. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................GTCGGTCGGCCCATCATCTTA................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................GTCCTCTATATAACGGTCGGC.............................................................................................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TTTACGTTGTGTGGGAACAGGAA.................................................................. | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................AGGTCGGCCCATCATCTTCGTC................................................................................................................ | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................TTTAGCGGGAACAGGAACTA............................................................... | 20 | 2 | 3 | 0.67 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................ACAGGAACTGTAAGTA......................................................... | 16 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................AATTTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 21 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................AACGGGAACAGGAACTATAAG........................................................... | 21 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................TTTTTGCGGGAACAGGAACTAT.............................................................. | 22 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................AACGGTCGGCCCATCATCTT.................................................................................................................... | 20 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................TTACGGTCGGCCCATCATC...................................................................................................................... | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................AATAAGTCTAGTACGCCTCT...................................... | 20 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TTTTTGTGCGGGAACAGGAACT................................................................ | 22 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................TTACCGTCGCCGCCTAGCTT................ | 20 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................ATTTTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................ACCGTCGCCCCCTAGTTT................ | 18 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ......................................................................................TTTTTGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 20 | 3 | 10 | 0.10 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...ATGTCGAAATTACCTTAGTC..................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................AGTCCTCCATAAGTCCGTC................................................................................................................................. | 19 | 3 | 15 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ......................................................................................AAAATGTGCGGGAACAGGAA.................................................................. | 20 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................ATGCCTTTGCGCGCCG.............................. | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTCCACTAGGTCGCCGT....................................................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ......................................................................................TTTTTGTGCGGGAACAGGA................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| droSim2 | x:3104922-3105093 - | dsi_2670 | GCA-----TT--CAGCTTCA--ATGGAACCA---GATCAGGAGATATACAGCCAGCCGGGTAGT---------AGAATCAGGCCAGCAGAAGGT------TATCAAGCGGCAATGCAACACGCCCTTGTCCTTGATATTCATGATTCAGATCATACGG------AGACGCGTGGCAGCGGCGGATCGAATCCCTTTCCGCAGGAC--- |
| droSec2 | scaffold_4:3304535-3304706 + | GCA-----TT--CAGCTTCA--ATGGAACCA---GATCAGGAGATATACTGCCAGCCGGGTAGT---------AGAATCAGGCCAGTAGAGGGT------TATCAAGCGGCAATGCAACACGCCCTTGTCCTTGATATTCATGATTCAGATCATACGG------AGACGCGTGGCAGCGGCGGATCGAATCCCTTTCCGCAGGAC--- | |
| dm3 | chrX:3357811-3357972 - | GTT-----TT--TAGCTTCA--ATGGATTCA---AATCAGGAGATATACTTTCAGCCGCGTTGTATGTCAGGTACAAATAGATCAGTAGTAG-------------------------AAAAATTCTTGTCTTTGATATTCATAATTTAGATCATATGG------AGATGCGTGGCAGCGGCGGATCGAATCCCTTATCGCAACAC--- | |
| droEre2 | scaffold_4690:766933-767084 - | GTT-----TT---GGCTTTGAGATGCAATCA---GATCTGGAGGTGTACAACCAGCCAGGTGCT-GGTCAAGTA-----------------GAT------TCGCCGGCGGAACGGCAATACGCCCATGACCCTGACATCCATGGTTCAAATCATGCGC------AGAGACGTGGCAGCGGCGGATCGAATCCC--------------- | |
| droYak3 | X:5023246-5023405 + | GAT-----TT--GGGTTTTG--ATGGAATCC---GATCTGAGGGTGTACTACCAGCCGGCTG----GCCAAGT-----------------GGGT------TCCCAGGCTGAACTGCAATGTGCCCTGGACCTTGATATTCATAATTCAGATCATACGG------AGACGCGTGGCAGTGGCGGTTCTAATCCTTTTCCGCAGGAC--- | |
| droEug1 | scf7180000409178:136120-136168 - | TGA-----TT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAGAACATTTGTCGT---CGGCTCGAGCCAATGCCGGAT------------CGGAGGGA--- | |
| droBia1 | scf7180000302126:1798324-1798465 + | TCA-----TTGCGGGATTTG--ATGGAATCC---GATTTGGAGGTGTACTACCAGGCGGCTG----GTCGGGT--------------GGAGGGC------TCCCAGGCGGAGCTGCCCTAC------------GATCTTGAGGATCCCGATCAATTGGCCACTC---CCCGTGGCAGCGGTGGCTCCAATC----------------- | |
| droTak1 | scf7180000415360:353274-353427 - | GCAAGAAATTCCAGGATTTG--ATGGGATCG---CACCTGGAGGTGTTCTACCAGCCGGGTG----ATCAG----------GCC----GAGGATTTCCAATCCCAGGCCGA------------------------AGATCTCCAGCTGGAAGATGCGGAGACGC---AGCGCGGCAGCGGTGGATCGAATCACTACCCAGAGGA---- | |
| droEle1 | scf7180000490996:568677-568730 - | GAT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATCGATCAAATGGATATGC---GTAGATCCAGCGGTGGATCGATCCACCGTTCG--------- | |
| droRho1 | scf7180000776529:358190-358246 + | GAT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTCGATCTGTCGG------AGATGCGGGGCAGCGGTGGCTCCAATCACTACTCGGAGGGC--- | |
| droKik1 | scf7180000302258:265715-265819 + | GCA-----G-----------------AGGTGGACGAGGAGGAT-GCCACCACCA----------------------------------------------------GCGATAACG-AGGAGGGCTTGCCCCTTGAGAT------ATTAAACCGCTCGG------AGACCCGCGGCAGTGGCGGCTCC------------GAGGGC--- | |
| dp5 | XL_group1a:7488494-7488527 + | CGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGACGATTCGGGGCAACTTTCGCAGCACCAT | |
| droPer2 | scaffold_13:2130842-2130886 + | CGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGAC----------------AATTCGGCGGCAACTTTTCGCAGCACCATTCGGAGGGG--- | |
| droVir3 | scaffold_13047:11814772-11814814 + | CAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGAGGCAGAG----AGGCGCACGGCGGCAGCTGCTGCAGC------------AAC--- |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| droSim2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droSec2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| dm3 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droEre2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droYak3 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droEug1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droBia1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droTak1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droEle1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droRho1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droKik1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| dp5 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droPer2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droVir3 |
|
Generated: 05/19/2015 at 05:40 AM