ID:dsi_22201 |
Coordinate:x:4966740-4966842 + |
Confidence:confident |
Class:Mirtron |
Genomic Locale:intron |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -7.2 | -7.1 | -6.9 |
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intron [x_4966740_4966842_+]; utr5 [utr5_plus_14039]; CDS [x_4966577_4966739_+]; CDS [x_4966843_4966992_+]; utr5 [utr5_plus_14038]
No Repeatable elements found
|
CCGCAAGCTGCTCGACCAGCATGGCTTCGAACGCAGTCTGCTCTCGAATTGTGAGTGGGGGAAACCCATGTACATATATTGAAATGCTCTATACCTTATAACTTGGGATTAGTAGACTAAATGGGTTGTGACTTTCGATTTCGCCCATTCAAGGGATTTGTTTGCTAGAGCACGAGAGCGATCTGGATACCGGCAGGATAACC
*************************************************************************************************......................(((((((.((........))...)))))))....************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
M023 head |
M024 male body |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
O002 Head |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
M053 female body |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
GSM343915 embryo |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAGT................................................. | 22 | 1 | 1 | 10.00 | 10 | 10 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAG.................................................. | 21 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAGA................................................. | 22 | 1 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ATAACTTGGGATTAGTAGACT..................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 0 | 3 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCA.................................................... | 19 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAA................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................CGAGAGCGATCTGGATACCGGC......... | 22 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............ACCAGCATGGCTTCGAACGCAGTCTG................................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTTGATTTCGCCCATTCAAGT................................................. | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................ATGGGTTGTGACTTTCGATTTCGCC.......................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................TTGGATTTGTTTGCTAGAGCACGAGA.......................... | 26 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................CTTTCGATTTCGCCCATTCAAGA................................................. | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................TAACTTGGGATTAGTAGACT..................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................ATGGGTTGTGGCTTTCGATTTCGCC.......................................................... | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................GTCTGCTCTCGAATTGTGAG.................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ATAACTTGGGATTAGTAGAC...................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................CAGTCTGCTCTCGAATTGTG...................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................GTGAGTGGGGGAAACCTAAGTA................................................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGTTCATTCAAG.................................................. | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATT...................................................... | 17 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....AGCTGCTCGACCAGCATGGCTTCGAACG.......................................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................CAAGGGATTTGTTTGCTAGA.................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................CGAGAGCGATCTGGATACC............ | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................TGGCTTCGAACGCAGTCT.................................................................................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTGCGCCCATTCAAG.................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAGG................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................................................ATCTGGATACCGGCAGGGC.... | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAA.................................................. | 21 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ....................................................................................................................................TTTCGATTTCGCCCATTCAAAA................................................. | 22 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGAATTCTGAGTGGG................................................................................................................................................ | 15 | 1 | 15 | 0.33 | 5 | 3 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................ATTTCCCCCATGCAAGGGA............................................... | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..............................................................................................................AGTAGAATAAATGGGTTATGACA...................................................................... | 23 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .............................................................................................CTTTATAGCTTGGGATTA............................................................................................ | 18 | 2 | 6 | 0.33 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................CGAATTCTGAGTGGGG............................................................................................................................................... | 16 | 1 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................TCACCCATGCAAGGGATT............................................. | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................TCGAATTGTGAGTGGT................................................................................................................................................ | 16 | 1 | 6 | 0.17 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................TTGTGGGTAGGGGAATCCC........................................................................................................................................ | 19 | 3 | 20 | 0.15 | 3 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................ATTGTGAGTCGGGTAACCC......................................................................................................................................... | 19 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................ACTTTATAGCTTGGGATT............................................................................................. | 18 | 2 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................CATATATAGAAATGCT................................................................................................................... | 16 | 1 | 11 | 0.09 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................AACTTTATAGCTTGGGATTA............................................................................................ | 20 | 3 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................GCCCTTATAGCTTGGGATT............................................................................................. | 19 | 3 | 15 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................GTTCGCCCATTCAAGCGGT.............................................. | 19 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................AAACTTTATAGCTTGGGATT............................................................................................. | 20 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................AATTGTGGGTAGGGGAATC.......................................................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................GGTATTGGGTTGCTAGAG................................. | 18 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................CTTTATAGCTTGGGATT............................................................................................. | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
|
GGCGTTCGACGAGCTGGTCGTACCGAAGCTTGCGTCAGACGAGAGCTTAACACTCACCCCCTTTGGGTACATGTATATAACTTTACGAGATATGGAATATTGAACCCTAATCATCTGATTTACCCAACACTGAAAGCTAAAGCGGGTAAGTTCCCTAAACAAACGATCTCGTGCTCTCGCTAGACCTATGGCCGTCCTATTGG
**************************************************......................(((((((.((........))...)))))))....************************************************************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M023 head |
M024 male body |
M053 female body |
O001 Testis |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .........................................................................................................................................................................CGTGCTCTCGCTAGACCTATG............. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................TACCGAAGCTTGCGTCAGACGA................................................................................................................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................CTCGTGCTCTCGCTAGACC................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................TATGGAATATTGAACCCT............................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................TCTCGTGCTCTCGCTAGACCT................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................TCGTGCTCTCGCTAGACCTAT.............. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................TACCGAAGCTTGCGTCAGACG.................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................TAATGTTACGAGATATGG............................................................................................................ | 18 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........ACCTGGTCGAACCCAAGCTTG........................................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..........GGGATGGTCGTACTGAAGC.............................................................................................................................................................................. | 19 | 3 | 10 | 0.20 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| .............................................................................TAACGTTACGAGATAGG............................................................................................................. | 17 | 2 | 15 | 0.13 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 1 |
| .............CTGTACGTACCGAAGC.............................................................................................................................................................................. | 16 | 2 | 20 | 0.10 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| ..............................................................................AACGTTACGAGATAGGG............................................................................................................ | 17 | 2 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .GCGATCGACGAGTTGGT......................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Type | Alignment |
|---|---|---|---|---|
| droSim2 | x:4966690-4966892 + | dsi_22201 | confident | CCGCAAGCTGCTCGACCAGC---ATGGCTTCGAACGCAGTCTGCTCTCGAATTGTGAGTG-GGGGAAACC-C--ATGTACATATATTGA-AATGCTCTATACCT---------------------------------TA-----TAACTTGGGATTAGTAGACT-----AAATGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTG-------TGACTTTCGAT----------------------------------TT----CG---CCCATTCAAGGGATTTGTTTGCTAGAGCACGAGAGCGATCTGGATACCGGCAGGATAACC |
| droSec2 | scaffold_4:1434090-1434285 - | dse_1279 | confident | CCGCAAGCTGCTCGACCAGC---ATGGTTTCGAACGCAGTCTGCTCTCGAATTGTGAGTG-GGGGAAACC-T--AAGTACTTATATTGA-AATGATCTATACCT---------------------------------T------------AGGATTAGTAGACT-----AAATGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTG-------TGACTTTCGAT----------------------------------TT----CG---CCCATTCAAGGGATTTGTTTGCTAGAGCACGAGAGCGATCTGGATACCGGCAGGATTACC |
| dm3 | chrX:5321674-5321888 + | CCGCAAGTTGCTCGATCAGC---ATGGTTTCGAACGCAGTCTGCTCTCGAATTGTGAGTG-GGAA--ACC-CAGATGTACATATATTAAAAATGCTCTATACTG---------------------------------TATGCTCTATCTTAAGATTAGCAAACTATTATAAATGGG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTG-------TGACTTTTGAT----------------------------------TT----TG--CCCCATTTAAGGGATTTGTTTGCTAGAGCACGAAAGCGATCTGGATACCGGCAGGATTACA | ||
| droEre2 | scaffold_4690:2675379-2675621 + | ACGCAAGCTGCTCGACCAGC---ATGGTTTCGAACGCAGTCTGCTCTCCAATTGTGAGTG-GGAA--ACC-T--ATGTA----TATTGA-AATGCACTATTCCGCACACATAGATGATGATGCTCGCAGATGTTCGTT------------CAGATCAATAGACT-----GAATGTCAGTAAGTTGTCAGT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AATCTTCTG-------TTACTTATGAT----------------------------------TT----CG---CCCATTTAAGGGATTTGTTTGCTCGAGCACGAGAGCGATCTGGATACGGGCAGGATCACC | ||
| droYak3 | X:3148469-3148657 - | ACGCAAGCTGCTCGACCAGC---ATGGCTTCGAACGCAGTCTGCTCTCCAATTGTGAGTG-GGTGTAACC-A--ATGTAGATATATC---AATGAT------------------------------------------------------------------CT-----AAATGGGGG----TGGCCAGT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATCTTCTG-------TGACTTATGAT----------------------------------TT----CG---CCCATTTAAGGGATTTGTTTGCTGGAGCACGAAAGTGATTTGGATACCGGCAGGATCGCC | ||
| droEug1 | scf7180000409095:341556-341751 + | CCGCAAGCTGCTCAATCAGC---ATGGTTTCGAACGAAGTCTGCTCTCGAACTGTGAGTG-GGAA--TCTACAGATGA------------------------------G----------------------------------------------------------------------------------------------A-------CAGAAGATATATTCTTTGGATGCTGTTGACA--------TTCT---------------------------------------------------------------------------------ATTCTATCTTCTA-------CGATATCCCAT------------------------------------------GTCTCAATTTAAGGGATCTGCTTGCTGGAACACGAGAGCGAGCTGGACACCAGCAGGGTCACC | ||
| droBia1 | scf7180000302069:498445-498682 - | CCGCAAGCTGCTCGAGCAGC---ATGGCTTCGAACGAAGTCTGCTTTCCAATTGTGAGTG-AGCA--AT---------------------------------------------------------------------------------------------AT-----GAT-------------------------------------------------------TTGAAAAGATGATAGTACCTTAGTACGAGAACGATTACATATTTTACCGAA-----------------------CAGTAATTGA--GTGATTAATACCAAATCAATAACTGTCATCTTCTG-------CGACCTCTTGT------------------------------------------TTTCCCATCTAAGGGATCTGCTTGCTGGAGCACGAGAGCGAACTGGAGACCAGCAGAACCACC | ||
| droTak1 | scf7180000415077:69060-69120 + | CCGCAAACTGCTCAACCAGC---ATGGCTTCGAACGAAGTCTACTTTCAAATTGTGAGTG-AGAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ||
| droEle1 | scf7180000491240:546428-546585 + | ACATGTGCTGGTGGATAAAT---ACAACTTCGACAAGTCTTTCATCTCCAACTGTAAGCG-AATT--TCA-G--ATCTAGATATA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTACTTTA--TTAAA-CTAATCGAT---TTTTGGTAGGGATCTGTCTGGTGGAGCACGAGAGTGAACTGAATACCAGCAAAATAACA | ||
| droRho1 | scf7180000779506:1445006-1445280 + | GCGAAAACTGCTCGATCAGC---ACGGTTTCGAACGAAGTCTGCTCTCCAATTGTGAGTG-GGAA--AT---------------------------------------------------------------------------------------------CT-----AATTGAATG----TGGACTTCTAAGCTCTAAGCACTTCTAAGCTCAAGTTACTTTCTTTTGAAATTGTTTTGGAGCTATCATACCATTATTATTAACTATTATACACAA-----------------------AG--------------TCAATACCAAATCTAAATA---GATCTTATT-------ATAATT--TA----------------------------CTT----T-------TTCCCCATTTTAGGGATATGTTTGCTGGAGCACGAGAGCGACCTAGAGTCCAGCAGGATCACC | ||
| droFic1 | scf7180000454072:2782210-2782463 - | CCGCAAACTCCTCGATCAGC---ATGGCTTCGAACGGAGTCTGCTCTCCAATTGTGAGTG-AGGT--GT---------------------------------------------------------------------------------------------TC-----ATTAGAAA-----------------ATCAATGTTCTTCGTCGTTCCTGTTCTATCCTA---------------------------------GTTTAAAAATTTACATGAGCAGTATTATGGTTTCAGCTCAAAC--------GT----ATTATACTATGTATATCCG---GGTATTGCT-------ATTAAT--TC----------------------------AAA----G-------TTCCTTGAACTAGGGATCTGCCTACTGGAGCACGAGAGCGATCTGGACACCACTAGGATCTCA | ||
| droKik1 | scf7180000302469:874115-874277 - | CAAGAAGCTGCTCGATCCGCCTTACAGGTTCGATCGATCGCTGCTCTCCAATTGTGAGTT-TATATT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGACT------TT-TACATCATATAAAATA--CTC---ATAAT-TTCC---TG---ACCCTTTCAGGGATCTGCCTGCTGGAGCACGAAAGCGACCTGGACACCAGCAGGATCACC | ||
| droAna3 | scaffold_13117:983888-984041 - | CCGTAAGCTGCTCGAACAAC---ACGGGTTCGAGCGCAGTTTGCTTTCCAATTGTGAGTTTAGCGA------------------------------------------A----------------------------------------------------------------------------------------------A-------T---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAAAATAGG----------------TA------------------------------GCCTC--TAGAA-TAATTTGGT-----TCCCCAGGGATTTGTCTTCTGGAGCACGAAAGCGAACTGGATACCAGCCGAACCACC | ||
| droBip1 | scf7180000396425:1134310-1134461 + | CCGTAAGCTGCTCGAACAAC---ATGGTTTCGAGCGTACTTTGCTTTCCAATTGTGAGTCTACCGA------------------------------------------A----------------------------------------------------------------------------------------------A-------T---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAAAAT--G----------------TA------------------------------GTCTC--GCAAC-TAATTTGGT-----TCCCCAGGGATTTGTCTCCTGGAGCATGAAAGCGAACTGGACACCAGCCGAACCACC | ||
| dp5 | XL_group1a:8692829-8693015 - | CCGCAAGCTGCTCGACCGGC---ACGGCTTTGAGCGCAGCCTTCTGTCCAACTGTAAGTA-GAAT--GT--------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTGATTGTCTCTA--GAGCCAATGGAA-------T-----------------------------------------------------------------------------------------------------T----------------TT------------GA--ATATTCTTGGCT------TT-TAAAACACAT--------------------CCC----CA---CCGGCCGCAGGGATCTGTCTTCTGGAGCACGAGAGCGAACTGGAGACGACCCGAACCACT | ||
| droPer2 | scaffold_15:1088431-1088617 - | CCGTAAGCTGCTCGACCGGC---ACGGCTTTGAGCGCAGCCTTCTGTCCAACTGTAAGTA-GAAT--GC--------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTGATTGGCTCTA--GAGCCAATGGAA-------T-----------------------------------------------------------------------------------------------------G----------------GT------------GG--ATATTCTTGGCT------TT-TAAAACACAT--------------------CCC----CA---CCGGCCACAGGGATCTGTCTTCTGGAGCACGAGAGCGAACTGGAGACGACCCGGACCACT | ||
| droWil2 | scf2_1100000004521:6474714-6474874 + | CCGTAAGCTGCTGAATCAGC---ATGGCTTTGAACGCAGTTTGCTATCCAATTGTGGGTA-TATAAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGGCT------TT-TAAAGATCA-----TA--ATCTTAGTGAA-TTTCAACCA---TAATTTACAGGGATTTGTCTGCTAGAACATGAAAGTGAATTGAACACTGCAAAAGTGACT | ||
| droVir3 | scaffold_12970:10652235-10652401 - | dvi_13922 | ACGGAAGCTGCTGGAACAGC---ACGGCTTTGAGCGCAGCCTGCTTTCCAGTTGTGAGTA-GCGG--GGC-------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGGGAGAGTTGCGAGT------GAACGGAC-------T---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTAACA--G----------------TGGGCT-----CT-TAT-----------------------------------------ATACACAGGGATATGCCTGCTGGAGCATGAGAGCGATCTGGACACCGCCAAGGTGACA | |
| droMoj3 | scaffold_6473:10759063-10759240 + | CAGGAAGCTGCTGGAGCAGC---ACAGCTTCGAGCGCAGCCTGCTCAGCAATTGTGAGTG-ACAGAAAGA-G--AGACAGAGAGAGAGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGAGAGAGAGAGA---GAGGGGGAG-------AGACTT--AAC----------------------------------TT----CC---GCACTTTCAGGGATATGTCTGCTGGAGCATGAGAGCGACTTGGACACAGCCAAGCTGACA | ||
| droGri2 | scaffold_14853:6117519-6117717 + | CCGCAAGCTGCTCGAACAGC---ACAGCTTTGAGCGCAGCCTGCTCTCCAATTGTGAGTACACAGA------------------------------------------GAGAGAGAGAGAGAGAGG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGAGAGATAGAGA---GAGAGAGAGAGATAGGGGGTC------TTTAAT-A--TA-----TA--GTCTTTGT----CTC----CA----CCTCACCAGGGATATGCTTGCTGGAGCATGAGAGCGAGTTGGATACCGCGAAGATGACA |
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Generated: 10/20/2015 at 07:13 PM