ID:dsi_16990 |
Coordinate:2r:2907420-2907662 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -20.8 | -20.8 | -20.7 |
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CDS [2r_2907419_2907419_+]; intron [2r_2905024_2907392_+]; exon [2r_2907393_2907419_+]; five_prime_UTR [2r_2907393_2907419_+]; exon [2r_2907663_2908056_+]; CDS [2r_2907663_2908056_+]; intron [2r_2907419_2907662_+]
No Repeatable elements found
| -----------------------###########################---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------################################################## TATAAGAGGGAATTTTCTGGAATAACCCGTAAATAAGTATGGATATACATATGTAAAATTCTTATCAAATATTTTAAAATAGAAATTTGTTGTGCTTACCCATAGGAAAAGAAAATGTGCGCTAGTGGAATTCGGTTGGCTTCTTTCAACAAAAAAAAAAACCTAAAAAACACCTCTTCTGTTATCGCTTGCAGTTCGCTAAACTAACCGCGTTTTTCAACACCATAACCCTTTGTGTCTGCCTGATTGTCATCCCCCGACCACCCCTATTACCGACGAAACCAATCTGATAGTGGCAGCTAGTCATCAACATGGTGGACATCAACTTGGAGTGCGTGCACCA ************************************************************************.......((((..(((.(((((......))))).))).(((((((((...(((((((.....(((((......)))))............................((((........))))))))))).......)))))))))......(((((....)))))))))................************************************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
M023 head |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
M053 female body |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
M025 embryo |
M024 male body |
O002 Head |
GSM343915 embryo |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCAACTTGGAGTGCGTG..... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................TTTAAAATAGAAATTT............................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................TGCTTACGAATAGGAAAAAAAAAT................................................................................................................................................................................................................................... | 24 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCATAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................TATTACCAACGAAACCAATCTGATAGTGGC.............................................. | 30 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................TTGGCTTGTGTCAACAAAAAAAAAA....................................................................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTAGTCATCAACATGGTG.......................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGATTGTCATCCCCC..................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................................................................CCTGATTGTCATCCCCCGAC.................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...........................................................................................................................................................................................................................................................ATCCCCCGACCACCCCTATTACCG.................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATCAACTTGGAGTGCGTGCACC. | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ................................................................................................TACCCTTAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTTAGGAAAAGAAAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 3 | 1.00 | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTGATTGTCATCCCCCGACCACCCC............................................................................ | 29 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTAGTCATCAACATGGTGGAC....................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................CTTACCCTTAGGAAAAGAAAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ACCCGTAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GTAAAGAAGTATGGAT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................GTACCCTTAGGAAAAGAAA..................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ACCCTTAGGAAAAGAAAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 10 | 0.40 | 4 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ACCCTTAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 5 | 0.40 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTGAGGAAAAGAAA..................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 8 | 0.38 | 3 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................CTCCTCTCTTATCGTTTGCAG..................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................CATAACCCATTGAGCCTGCC.................................................................................................... | 20 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...............................................................................................GTACCCTTAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 11 | 0.27 | 3 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCAGAGGAAAAGATA..................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCAGAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 5 | 0.20 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................GTACCCTTAGGAAAAGAA...................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GTAAAGAAGTATGGAGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................CTACCCGTAGGAGAAGAAAA.................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ................................................................................................TACCCACAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ......................TAACATGTAAAGAAGTATGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTTAGGAAAAGAAATC................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 12 | 0.17 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTGAGGAAAAGAA...................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.15 | 3 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................TTCTTTCAATAAAAAAAAA........................................................................................................................................................................................ | 19 | 1 | 7 | 0.14 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................AAATAAGTCTGGCTATAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACTTCAACTTGGA............ | 16 | 1 | 9 | 0.11 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................GCTTCTTTCAACAGA.............................................................................................................................................................................................. | 15 | 1 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................ACCCAGAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 12 | 0.08 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................CCCTTAGGAAAAGAA...................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | 1 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCACAGGAAGAGAA...................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 16 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................TTCTTTCAATAAAAAAAA......................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 17 | 0.06 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| TATAAGAGGGAATTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 15 | 1 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................TTTAAAATAGAAATTTT.............................................................................................................................................................................................................................................................. | 17 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................CCCTTAGGAAAAGAAAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTGAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................CAGTACCCATAGGAAAAGA....................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................TACCCTTAGGAATAGACA..................................................................................................................................................................................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
|
ATATTCTCCCTTAAAAGACCTTATTGGGCATTTATTCATACCTATATGTATACATTTTAAGAATAGTTTATAAAATTTTATCTTTAAACAACACGAATGGGTATCCTTTTCTTTTACACGCGATCACCTTAAGCCAACCGAAGAAAGTTGTTTTTTTTTTTGGATTTTTTGTGGAGAAGACAATAGCGAACGTCAAGCGATTTGATTGGCGCAAAAAGTTGTGGTATTGGGAAACACAGACGGACTAACAGTAGGGGGCTGGTGGGGATAATGGCTGCTTTGGTTAGACTATCACCGTCGATCAGTAGTTGTACCACCTGTAGTTGAACCTCACGCACGTGGT
**************************************************************************************.......((((..(((.(((((......))))).))).(((((((((...(((((((.....(((((......)))))............................((((........))))))))))).......)))))))))......(((((....)))))))))................************************************************************************ |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M024 male body |
M053 female body |
SRR1275487 Male larvae |
M023 head |
SRR1275483 Male prepupae |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR902009 testis |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
M025 embryo |
GSM343915 embryo |
O001 Testis |
SRR1275485 Male prepupae |
SRR902008 ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 19 | 3 | 12 | 178.08 | 2137 | 1536 | 211 | 24 | 244 | 8 | 11 | 15 | 15 | 11 | 5 | 3 | 53 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 20 | 3 | 2 | 141.50 | 283 | 213 | 14 | 5 | 37 | 0 | 0 | 1 | 4 | 1 | 3 | 3 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 18 | 2 | 1 | 104.00 | 104 | 16 | 24 | 19 | 7 | 12 | 2 | 6 | 7 | 2 | 4 | 3 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 18 | 3 | 20 | 94.40 | 1888 | 0 | 1796 | 92 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 17 | 2 | 5 | 42.80 | 214 | 0 | 0 | 87 | 0 | 55 | 17 | 30 | 1 | 18 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 19 | 2 | 1 | 29.00 | 29 | 3 | 8 | 3 | 2 | 1 | 2 | 0 | 3 | 4 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 18 | 2 | 3 | 20.67 | 62 | 43 | 12 | 0 | 4 | 0 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 18 | 2 | 1 | 16.00 | 16 | 9 | 3 | 1 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 18 | 2 | 1 | 14.00 | 14 | 1 | 1 | 2 | 0 | 0 | 3 | 0 | 1 | 1 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 17 | 2 | 2 | 11.00 | 22 | 0 | 0 | 6 | 0 | 2 | 8 | 1 | 1 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGAT.......................................................................... | 16 | 2 | 13 | 10.77 | 140 | 0 | 0 | 31 | 0 | 15 | 18 | 36 | 6 | 13 | 13 | 7 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGTAGGGATAA........................................................................ | 19 | 2 | 2 | 6.00 | 12 | 9 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGGCAGGGATAATT...................................................................... | 19 | 3 | 6 | 5.83 | 35 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 15 | 0 | 3 | 12 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 16 | 2 | 12 | 5.67 | 68 | 0 | 0 | 10 | 0 | 6 | 22 | 17 | 0 | 12 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGATAATT...................................................................... | 20 | 3 | 5 | 5.40 | 27 | 5 | 5 | 2 | 2 | 1 | 2 | 1 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 17 | 2 | 1 | 5.00 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCGGGGATA......................................................................... | 18 | 2 | 3 | 4.67 | 14 | 10 | 1 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCGGGGATAA........................................................................ | 19 | 2 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TACGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 19 | 3 | 5 | 3.00 | 15 | 3 | 6 | 2 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TACGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 20 | 3 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 19 | 2 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGATAGGGATAAT....................................................................... | 19 | 2 | 2 | 2.50 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TACGGGGCTGGCAGGGAT.......................................................................... | 18 | 3 | 19 | 2.26 | 43 | 16 | 20 | 4 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCGGGGATAATT...................................................................... | 21 | 3 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 15 | 2 | 20 | 1.65 | 33 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 9 | 20 | 0 | 0 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................CTAGGGGGCTGGCAGGGAT.......................................................................... | 19 | 3 | 5 | 1.60 | 8 | 1 | 6 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 16 | 2 | 9 | 1.44 | 13 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 3 | 6 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 19 | 3 | 8 | 1.38 | 11 | 9 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................CTACGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 20 | 3 | 2 | 1.00 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........TTAAAAGACCTTATTGGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGTGGGGATA......................................................................... | 18 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCGGGGATAAT....................................................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 18 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TAGGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 19 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGCTGGCAGGGAT.......................................................................... | 17 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGCCGGGATAAT....................................................................... | 20 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 19 | 3 | 5 | 1.00 | 5 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGGGGTAATGGTTGCTTT.............................................................. | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGATAGGGATAAT....................................................................... | 20 | 3 | 5 | 0.80 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................TGGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 19 | 3 | 11 | 0.73 | 8 | 4 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGATAGGGATAA........................................................................ | 18 | 2 | 3 | 0.67 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGTAGGGAT.......................................................................... | 17 | 2 | 7 | 0.57 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................ACGGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 19 | 3 | 16 | 0.56 | 9 | 4 | 1 | 0 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 20 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGCTGGCAGGGATAAT....................................................................... | 19 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGGCTGGTAGGGATAATT...................................................................... | 21 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGTAGGGAT.......................................................................... | 16 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCCGGGATA......................................................................... | 17 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................ACGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 19 | 3 | 4 | 0.50 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................TGGTTTTGGGAAACAC.......................................................................................................... | 16 | 1 | 5 | 0.40 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGATAGGGATAA........................................................................ | 17 | 2 | 8 | 0.38 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGATAGGGATAATT...................................................................... | 20 | 3 | 6 | 0.33 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGGGGCTGGTAGGGAT.......................................................................... | 18 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGATAGGGATAAT....................................................................... | 18 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................CAGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 18 | 3 | 20 | 0.30 | 6 | 5 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGGGCTGGCAGGGATA......................................................................... | 19 | 3 | 8 | 0.25 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................TCAAGCGACTTGATTGGT..................................................................................................................................... | 18 | 2 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...........................................................................................................................................................................................................................................................TCGGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 20 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................CTACGGGGCTGGTAGGGAT.......................................................................... | 19 | 3 | 9 | 0.22 | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGGCTGGTAGGGATA......................................................................... | 18 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTGGCGGGGATA......................................................................... | 15 | 1 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .....................................................................................................................................................................................................................................................TATCAGTACGGGGCGGGTGG.............................................................................. | 20 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................TTGGCGCAAAAAGTTGAA........................................................................................................................ | 18 | 2 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................GACGGGGGCTGGTAGGGAT.......................................................................... | 19 | 3 | 15 | 0.13 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGCTGGCGGGGATA......................................................................... | 17 | 2 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGATAGGGATA......................................................................... | 17 | 2 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................................ATCTTATTGGCGCAAAA............................................................................................................................... | 17 | 2 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGTTCAGTAGTTGTAC............................. | 18 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .............................................................................................................................................................................................................................................................CGGGGCTGGCAGGGATAA........................................................................ | 18 | 3 | 16 | 0.06 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGGGAGAAT....................................................................... | 19 | 3 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGGCTGGCAGTGATAA........................................................................ | 18 | 3 | 18 | 0.06 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................................................GGGGCTGGCTGGGATA......................................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ............................................................................................................................................................................................................................................................AGGGGGCTGGCAGGGA........................................................................... | 16 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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Generated: 05/18/2015 at 08:19 PM