ID:dsi_14108 |
Coordinate:2l:8170904-8171164 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -12.0 | -11.6 | -11.4 | -11.1 |
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CDS [2l_8169557_8172829_+]; exon [2l_8169361_8172829_+]
No Repeatable elements found
| mature | star |
| ######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### AAAAAGATACATTTTTAAATTTGGAAAAGCCGCATGGAAAGCACAGAAGCGTCAAAAAAAACAATGCAGCGATTGAAGACGAGTTTTTGCAAAAGGATACATTTCCAAATTTGGAAAAACCGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCCGAAAAAACAATGAAGCGATTGAAGACGAGTTCTTGCAAAAGGATACATTTCCAATTTTGAAAAAGCCGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCCGAAAAAACAATGAAGCGATTGAAGACGAGTTCTTGCAAAAGGATACATTTCCAATTTTGGAAAAGCCGCATGGAAAGCACAGAACAGTCAGAAAAAACCATACAGAAGAAGAAAACGGTTCATTGCA *********************************************************************************************************************************************************((.......((.((..((..((((((.....((((...((((((.................))))))..........)))).......))).))).)).)).)).....))************************************************************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR902009 testis |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
M023 head |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCAGA................................... | 26 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................................................................................................CGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCAGA............................................................................................................................. | 26 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................ACAGAACCGTCAAAAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 16 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................CGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCAGA....................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................CGATCGAAGACGTGTTCTT....................................................................................................................................................................................... | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................CGATCGAAGACGTGTTCTT............................................................................................. | 19 | 2 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .......................................................................................................................................................................................................................................................AGCGATTGAAGACGA................................................................................................... | 15 | 0 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
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|
TTTTTCTATGTAAAAATTTAAACCTTTTCGGCGTACCTTTCGTGTCTTCGCAGTTTTTTTTGTTACGTCGCTAACTTCTGCTCAAAAACGTTTTCCTATGTAAAGGTTTAAACCTTTTTGGCGTACCTTTCGTGTCTTCTCAGGCTTTTTTGTTACTTCGCTAACTTCTGCTCAAGAACGTTTTCCTATGTAAAGGTTAAAACTTTTTCGGCGTACCTTTCGTGTCTTCTCAGGCTTTTTTGTTACTTCGCTAACTTCTGCTCAAGAACGTTTTCCTATGTAAAGGTTAAAACCTTTTCGGCGTACCTTTCGTGTCTTGTCAGTCTTTTTTGGTATGTCTTCTTCTTTTGCCAAGTAACGT
*************************************************************************************************((.......((.((..((..((((((.....((((...((((((.................))))))..........)))).......))).))).)).)).)).....))********************************************************************************************************************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
SRR902008 ovaries |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
M053 female body |
SRR902009 testis |
M023 head |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Generated: 05/18/2015 at 06:43 PM