ID:dsi_11479 |
Coordinate:x:2192424-2192665 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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intergenic
No Repeatable elements found
|
CAATGAAACCGCCAGCGTGTTTAAGGACACTGTATCCATTACCATAACCAGTAAGTAATGCTCATCTGTCCGCAAATGTGTACCAATGCATTAATCATTCGCTTAACCTTATACAAATTGCCGCATTTATCAAAGGATATGCCCAGGAAATGCTGGCACGCTACGGTATTTTACATTTTTAAACATAAGATATGATTTTGTATATGGATTTTACCTCATTAAGCCCCCAATATCTATGAAAGCCGTATTGACGCTCAGTATCCTTTTCTTAAACTTAAAATGTAACCCACAGAGAAGGACCAGCTCTCACCGGCTGAGATTGTGAATTTACCGAGCCACGTT
**************************************************.((((((((((......((.(((....))).))....)))))).......((((((((.((((((((.((((((((((.((...((......)).)))))))).)))).......((((((((............))))))))...)))))))).))...........)))))).............(((((..(((((((...))))))).)))))......))))...............************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
M025 embryo |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
M023 head |
SRR902009 testis |
M053 female body |
M024 male body |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
SRR902008 ovaries |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ..........GCCAGCGTGTTTAAGGACA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGAGATTGTGAATTTACCGAGCCACG.. | 27 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGGACCAGCTCTCACCGGCT........................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGAGATTGTGAATTTACCA......... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........CGCCAGCGTGTTTAAGGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTCTCACCGGCTGAGGTTGT................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...TGAAACCGCCAGCGTGTTTAAGGACAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGATTGTGAATTTGCCGAGCCACGTT | 28 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAGATTGTGAATTTACC.......... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAGATTGTGAATTTACCGAGCCACGT. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGATTGTGAATTTACCGAGCCACG.. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................AAGGACACTGTATCCATTACC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTGAGATTGTGAATTTACCG......... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................GTTTAAGGACACTGTATCCATTACC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGATTGTCAATTTACCGAGCCACGT. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................TTAAGGACACTGTATCCATTACC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGGCTGAGATTGTGAATTTACCGAGC...... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAGATTGTGAATTTACCGAGCCGCGT. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCAAGAAGGACCAGCTCTCACC............................... | 24 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCGGCTGAGATTGTGAATTTACC.......... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATTGTGAATTTACCGAGCCACG.. | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...........................................................................................................................................................................................................................TAAGCCCCCGATATCCA.......................................................................................................... | 17 | 2 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
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| .................................................................................................................................................................................................................................................GCCGTAGTGACTCTCA..................................................................................... | 16 | 2 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
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|
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Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M024 male body |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTTCTTGGTCGATAGAGGCC............................. | 22 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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