ID:dsi-mir-982a |
Coordinate:x:3954410-3954501 - |
Confidence:Known |
Class:Unknown |
Genomic Locale:3pUTR |
[View on miRBase] [View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -18.9 | -18.9 | -18.8 |
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utr3 [utr3_minus_9914]
No Repeatable elements found
|
CCTAAAAAATATGTTTAAATAAAAAGGAACAAATGTATCAAGTTAAAAAACGAAATCATGCTAGATCATTAACAAGTATCATGTAAATTGAATTTTTGTATATATCAATTACATGTTATTCGTTCTTGAACTTAATGGTTTTAGAGCTGCAAGAAAAATTGTGAAATTTTTTATAAATATTACAAATATTAT
*****************************************************((((((...((.(((..(((.((((.(((((((.((((((........)).))))))))))).)))).)))..))).))..))))))...************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | SRR902009 testis |
SRR618934 dsim w501 ovaries |
M024 male body |
O001 Testis |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR553485 Chicharo_3 day-old ovaries |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
M025 embryo |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
GSM343915 embryo |
M023 head |
M053 female body |
O002 Head |
SRR902008 ovaries |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 350.00 | 350 | 79 | 42 | 143 | 59 | 0 | 1 | 0 | 15 | 0 | 3 | 7 | 1 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 120.00 | 120 | 26 | 66 | 0 | 7 | 4 | 4 | 8 | 0 | 1 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTTG................................................................ | 22 | 0 | 1 | 110.00 | 110 | 26 | 2 | 62 | 1 | 1 | 0 | 0 | 18 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATT....................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 51.00 | 51 | 35 | 2 | 0 | 7 | 3 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 1 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAAA................................................................................................... | 25 | 1 | 1 | 50.00 | 50 | 6 | 42 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAAT........................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 23.00 | 23 | 5 | 2 | 0 | 16 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAA......................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 17.00 | 17 | 1 | 1 | 1 | 13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAA.......................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 13.00 | 13 | 0 | 0 | 0 | 13 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTT................................................................. | 21 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 7 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTA...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAAAA.................................................................................................. | 26 | 2 | 1 | 7.00 | 7 | 2 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTGG................................................................ | 22 | 1 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................GTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 17 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................AAGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................ATTAACAAGTATCATGTAAATTGA..................................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATAA...................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TAAACAAGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTTGT............................................................... | 23 | 1 | 1 | 3.00 | 3 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTTGAA.............................................................. | 24 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGG..................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAC.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCT.................................................................. | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................TTGTTAACAAGTATCATGTAAA......................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................ATTAACAAGTATCATGTAAATTGAAA................................................................................................... | 26 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTTGA............................................................... | 23 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAAAAA................................................................................................. | 27 | 3 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTT.................................................................... | 18 | 0 | 2 | 1.50 | 3 | 1 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTAAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTT...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................TTACATGTTATTCGTTCTTGA............................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCACGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAACTGAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGGAAATTG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................AGTATCATGTAAATTGA..................................................................................................... | 17 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATGG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................ATAACAAGTATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................ATTGTTAACAAGTATCATGTAA.......................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGAAGGTG................................................................................................ | 28 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAACTGA..................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGATCA.................................................................................................. | 26 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................AGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTCAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TCAACAAGTATCATGTAAATTA...................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................TACATGTTATTCGTTCTTGAAC............................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................TCATTAACAAGTATCATGTAAATT....................................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................ATTGTTAACAAGTATCATGTAAA......................................................................................................... | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAATTATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATA....................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................ATTAACAAGTATCATGTAAATT....................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ....................................................................TTAACAAGCATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ....................................................................TTAACAAGTGTCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................CAAGTATCATGTAAATTGA..................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TAAACAAGTATCATGTAAATTGAAA................................................................................................... | 25 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................TAACAAGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................TAACAAGTATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................ATAACAAGTATCATGTAAATTGA..................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTACCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAGCGAGTATCATGTAAATTGAA.................................................................................................... | 24 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................GTTAACAAGTATCATGTAAATT....................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAATTGC..................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AATTACATGTTATTCGTTCTC................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAATAAGTATCATGTAAATTG...................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................GTATCATGTAAATTGA..................................................................................................... | 16 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TTAACAAGTATCATGTAAAAA....................................................................................................... | 21 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................ATTTAACAAGTATCATGTAAAA........................................................................................................ | 22 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................TATCATGTAAATTGAAA................................................................................................... | 17 | 1 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................CAAGAAAACTGGTGAACTTTTT..................... | 22 | 3 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................GGAATAAAAATTGTGAAATTT....................... | 21 | 2 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................GAAAAATTGTGAAATT........................ | 16 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................GAAAAATTGTGAAATTT....................... | 17 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................AACTGTATCAGGTTAAAA................................................................................................................................................ | 18 | 2 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................TCTTGGTCTGAATGGTTTTA................................................. | 20 | 3 | 13 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................TTGTGAAAGTTTTTATATA............... | 19 | 2 | 14 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................AATGGATTTAGAGCT............................................ | 15 | 1 | 15 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................GTATCAAGTAAAAAAA.............................................................................................................................................. | 16 | 1 | 19 | 0.05 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................TCTTGAACTGCATGGTT.................................................... | 17 | 2 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
|
GGATTTTTTATACAAATTTATTTTTCCTTGTTTACATAGTTCAATTTTTTGCTTTAGTACGATCTAGTAATTGTTCATAGTACATTTAACTTAAAAACATATATAGTTAATGTACAATAAGCAAGAACTTGAATTACCAAAATCTCGACGTTCTTTTTAACACTTTAAAAAATATTTATAATGTTTATAATA
*************************************************((((((...((.(((..(((.((((.(((((((.((((((........)).))))))))))).)))).)))..))).))..))))))...***************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | GSM343915 embryo |
SRR553488 RT_0-2 hours eggs |
SRR553486 Makindu_3 day-old ovaries |
SRR553487 NRT_0-2 hours eggs |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................................................................TCTCGTCGTTCTGTTTCACACT............................ | 22 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................AGTATTTGTTCATAG................................................................................................................ | 15 | 1 | 17 | 0.06 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ............................................TTTTTTGCTGTAGTA..................................................................................................................................... | 15 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .............................................................................................AGAACATATATAGTT.................................................................................... | 15 | 1 | 20 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Type | Alignment |
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Generated: 10/20/2015 at 06:59 PM