ID:dan_858 |
Coordinate:scaffold_12935:34653-34803 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
|
|
|
|
|
| -11.3 | -11.1 |
 |
 |
exon [dana_GLEANR_13915:2]; CDS [Dana\GF13859-cds]; intron [Dana\GF13859-in]; Antisense to intron [Dana\GF13858-in]
No Repeatable elements found
| mature | star |
| ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------################################################## TTAACAGTTGAGACGATGTCGATATACATCAAAAATTGTGTAAGTAATAAGAATACATTATTTAGTATTATACGATCGTATAATACAATCATACGTTTTAATATTTTTCCAGAACGTAGCTTTATACGAATATGTGCCACGTCGTGGTCGCTGCGCCCCGGGAGCCCTACGCGGACGGGCCCCGAGGACAGGCCCCGATAGCGCCCCGCGGACGGGCCCCGGGAGAGCAAGGTGAACGGGCCCCGGGACGT ********************************************************************..((((.((((((((........((((((((...........))))))))...))))))))...))))........*********************************************************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M044 female body |
M058 embryo |
V039 embryo |
V105 male body |
V106 head |
V055 head |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ....................................................................TATACGATCGTATAATACAATCATACGTT.......................................................................................................................................................... | 29 | 0 | 2 | 2.50 | 5 | 0 | 4 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .TAACAGTTGAGACGATGTCGATA................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................TAATATTTTTCCAGAACGTAG.................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................CTTTATACGAATATGTGCCACGTCG........................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................TTTATACGAATATGTGCCACGTCGT.......................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................CGAGAACGTAGGTTGATACG........................................................................................................................... | 20 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................TTTATACGAATATGTGCCACGTCGTGG........................................................................................................ | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................CTTTATACGAATATGTGCCACGTCGT.......................................................................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................TATACGAATATGTGCCACGTCGTGGTCGC.................................................................................................... | 29 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................GTAAGTAATAAGAATACATTATT............................................................................................................................................................................................. | 23 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................TGGTCGCTGCGCCCCGGGAGCCCTAC................................................................................. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................TATACGAATATGTGCCACGTCGTGGTCG..................................................................................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .TAACAGTTGAGACGATGTCGATATAC................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................GAGCAAGGTGAACGGGCCCCGG..... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................TGGTCGCTACGCCCCGGGAGCCCTAC................................................................................. | 26 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...ACAGTTGAGACGATGTCGATATA................................................................................................................................................................................................................................. | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................TACGATCGTATAATACAATCATACGTT.......................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| TTAACAGTTGAGACGATGTCG...................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .....................................................................ATACGATCGTATAATACAATCATACGTT.......................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 2 | 1.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................TCGCTGCGCCCCGGGAGCCCTACGCG.............................................................................. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................GAGGACAGGCCCCGATAGCGCCCCGCG......................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .......................................................................................................................................................TGCGCCCCGGGAGCCCTACGCGGAC........................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .TAACAGTTGAGACGATGTCGAT.................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .TAACAGTTGAGACGATGTCGATAAA................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................CTTTATACGAATATGTGCCACGTC............................................................................................................ | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................GACGGGCCCCGAGGACAGGCCCCGA..................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....AGTTGAGACGATGTCGATA................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................TGCGCCCCGGGAGCCCTACGCGGACGG......................................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .TAACAGTTGAGACGATGTCGGT.................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................TACGATCGTATAATACAATCATACGTC.......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TATACGATCGTATAATACAATCATACG............................................................................................................................................................ | 27 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................GGGTAAGTAATAAGAATACATTATT............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................TATACGATCGTATAATACAAACATCCGC........................................................................................................................................................... | 28 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................TATTATACGATCGTATAATACC.................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 6 | 0.50 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................TACGATCGTATAATACAATCATACGTTT......................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................GACGATCGTATAATACAATCATACGTT.......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................CCCCGAGGACAGGCCCCGATAGCGCC.............................................. | 26 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................TACGATCGTTTAATACAATCATACGGT.......................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................CCCCGATAGCGCCCCGCGGACGGGCC................................. | 26 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................CCCGATAGCGCCCCGCGGACGGGC.................................. | 24 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................................................................................................................................CGATAGCGCCCCGCGGACGGGCCCCG.............................. | 26 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................CGTTATACGAATATGTGCCACG.............................................................................................................. | 22 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................................................................................................................GATAGCGCCCCGCGGACGGGCCCCGG............................. | 26 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................AACGTAGCTTTATACGAATATGTGCC................................................................................................................. | 26 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................TACAATCATACGTTACAACATTT................................................................................................................................................. | 23 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................GACAGGCCCCGATAGCGCCCC............................................ | 21 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................................AGCGCCCCGCGGACGGGCCCCGG............................. | 23 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................................AGCGCCCCGCGGACGGGCCCCGGGA........................... | 25 | 0 | 7 | 0.14 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................................................AGCAAAGCGAACGGGCCTCG...... | 20 | 3 | 12 | 0.08 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ...............................................................................................................................................................GGGAGCGCGACGCGGACGGCC....................................................................... | 21 | 3 | 15 | 0.07 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
|
AATTGTCAACTCTGCTACAGCTATATGTAGTTTTTAACACATTCATTATTCTTATGTAATAAATCATAATATGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAAAATTATAAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCTTATACACGGTGCAGCACCAGCGACGCGGGGCCCTCGGGATGCGCCTGCCCGGGGCTCCTGTCCGGGGCTATCGCGGGGCGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGTTCCACTTGCCCGGGGCCCTGCA
***********************************************************************************************************..((((.((((((((........((((((((...........))))))))...))))))))...))))........******************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M058 embryo |
M044 female body |
V039 embryo |
V105 male body |
V055 head |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................AAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 26 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 4 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| ..............................................................................ATATTATGTTAGTATGCAAAATTAT.................................................................................................................................................... | 25 | 0 | 2 | 2.50 | 5 | 4 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ........................ATGTAGTTTTTAACACATTCATTAT.......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 0 | 4 | 2.25 | 9 | 2 | 7 | 0 | 0 | 0 |
| ...TGTCAACTCTGCTACAGCTATATGTAG............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................ATAAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 28 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...TGTCAACTCTGCTACAGCTATATGT............................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................CATATTATGTTAGTATGCAAAATTAT.................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 2 | 2.00 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................................................TCGGGATGCGCCTGCCCGGGGCTCCT............................................................... | 26 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...TGTCAACTCTGCTACAGCTATATGTAGT............................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................ATGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAAA......................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 2 | 1.50 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................ATGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAA.......................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 2 | 1.50 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................AAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..TTGTCAACTCTGCTACAGCTATATGT............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................CACGGTGCAGCACCAGCGACGCGG.............................................................................................. | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................TAAAAAGGTCTTGCATAGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................................................................................................................................................CTGCCCGGGGCCCTCTCGTTCCACCGC.............. | 27 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................TATAAAACGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 29 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................GCACCAGCGACGCGGGGTCCTCGGGA................................................................................... | 26 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................CAGCACCAGCGACGCGGGGCCCT........................................................................................ | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................CACGGTGCAGCACCAGCGACGCGGG............................................................................................. | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........TCTGCTACAGCTATATGTAGTTTGT........................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................GGGGCCCTCGGGATGCGCCTGCC......................................................................... | 23 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................................GGATGCGCCTGCCCGGGGCT.................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................CGCGGGGCCCTCGGGATTCGCCT............................................................................ | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............CTACAGCTATATGTAGTTTTTAACATA.................................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................CTCGGGATGCGCCTGCCCGGGGCTCCT............................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....TTCAACTCTGCTACACCTATATCTAG............................................................................................................................................................................................................................. | 26 | 3 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................CTCGTTCCACTTGCCCGGGGCCCT... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................................................................................................................................CTCGTTCCACTTGCCCGGGGCCCTGC. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................TAAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................................................................CCGGGGCCCTCTCGTTCCATTGG.............. | 23 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................................CGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGTTCCA.................. | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................................CGCGGGGCCCTCGGGATGCGCC............................................................................. | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................ACGGTGCAGCACCAGCGACG................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................GGCGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGTTCCA.................. | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................AAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCTC......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................AAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...................................................................................................CTATAAAAAGGTCTTGCATCGAAATAT............................................................................................................................. | 27 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................................................................................GCGGGGCCCTCGGGATGCGCCT............................................................................ | 22 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...TGTCAACTCTGCTACAGCTATATTT............................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................TGCAGCACCAGCGACGCGGGGCCC......................................................................................... | 24 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................AGCACCAGCGACGCGGGGCCC......................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......CAACTCTGCTACAGCTATATGTAGTTTTT........................................................................................................................................................................................................................ | 29 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................................................................CCGGGGCCCTCTAGTTCTA.................. | 19 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ....................................................................................................TATAAAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 29 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................................................................................................................................................CGGGGCCCTCTCGTTCCACTT............... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................................................................................CGACGCGGGGCCCTCGGGATGCGCCT............................................................................ | 26 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................AAAAGGTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 25 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................................................................GATGCGCCTGCCCGGGGCTCTTGT............................................................. | 24 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................CTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 18 | 0 | 3 | 0.67 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................TCATTATTCTTATGTAATAAATCATAAT..................................................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................................................................................GGTGCAGCACCAGCGACTCGGGGC........................................................................................... | 24 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................GTAGTTTTTAACACATTCATTATTCTT...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................TCTTATGTAATAAATCATAATATGCT................................................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................GTAATTTTTAACACATTCATTATTCT....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................ATATTCTGTTAGTATGCAAAATTAT.................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .........................................................................CTAGCATATTATGTTAGTATGCA........................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................TGTAGTTTTTAACACATTCATTATCCT....................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................TCATTATTCTTATGTAATAAATCAT........................................................................................................................................................................................ | 25 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................CCATAATATGCTAGCATATTAT...................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 6 | 0.50 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................TCTTATGTAATAAATCATAATATGCTAG.............................................................................................................................................................................. | 28 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................ATGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAAAA........................................................................................................................................................ | 29 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................ATTATGTTAGTACGCAAAATTAT.................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ......................................................................AAGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAAA......................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................TGCTAGCATATTATGTTAGTATGCAAAAT....................................................................................................................................................... | 29 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ................................................................................ATTATGTTAGTATGCAAAATTAT.................................................................................................................................................... | 23 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................CTGTCCGGGGCTATCGCGGGGCGCGT....................................... | 26 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................TTATGTTAGTATGCAAAAT....................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................GTCTTGCATCGAAATATGCT.......................................................................................................................... | 20 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................CGAAATATGCTTATACACGGTGCCGCAC......................................................................................................... | 28 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................CTTGCATCGAAATATGCTTGT....................................................................................................................... | 21 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................ATGTAATAAATCATAATATGCTAGCAT........................................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................CATAATATGCTAGCATATTATTT.................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................TCATAATATGCTAGCATATTAT...................................................................................................................................................................... | 22 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................................CCGGGGCTATCGCGGGGCGCCT....................................... | 22 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................TCCGGGGCTATCGCGGGGCGCGT....................................... | 23 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................CTGTCCGGGGCTATCGCGGGGCGC......................................... | 24 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................TGTAATAAATCATAATATGCTAGCATAT......................................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................................................................................................................................CGGGGCTATCGCGGGGCGCCT....................................... | 21 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................TGTAATAAATCATAATATGCTAGCAT........................................................................................................................................................................... | 26 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................TCCGGGGCTATCGCGGGGCGCCT....................................... | 23 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................................................................CGAAATATGCTTATACACGGTGCCGC........................................................................................................... | 26 | 1 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................................................................................GTCCGGGGCTATCGCGGGGCGC......................................... | 22 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................................................TTGCATCGAAATATGCTTATACACG.................................................................................................................. | 25 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................CTATATGTAGTTTTTAACACATTCATT............................................................................................................................................................................................................ | 27 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................ATATGTAGTTTTTAACACATTCATT............................................................................................................................................................................................................ | 25 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..ATGTCAACTCTGCTACAGC...................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................ATGTAGTTTTTTACACATTCATTAT.......................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................ATATGTAGTTTTTAACACATTCATTAT.......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 4 | 0.25 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .............................................................................................................................................................................................................GGCGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGTT..................... | 25 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................................................................................................................................GGGGCGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGT...................... | 26 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................................................................................................................................CGGGGCGCCTGCCCGGGGCCCTCTCGTT..................... | 28 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................TGTAGTTTTTAACACATTCATT............................................................................................................................................................................................................ | 22 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................TTAATGTAGTTTTTAACACATTCATTAT.......................................................................................................................................................................................................... | 28 | 2 | 5 | 0.20 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................TGTAGTTTTTAACACATTCATTAT.......................................................................................................................................................................................................... | 24 | 0 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ......CAACTCTGCTACCGCTATATGTAGTTT.......................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5 | 0.20 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................................................TCTTTCCACTTGGCCTGGGC...... | 20 | 3 | 6 | 0.17 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| .....CCAACTCTGCCACAGCTAAA.................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................................................................................................................................TGGCTATCGCGGGGTGTCTG...................................... | 20 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| droAna3 | scaffold_12935:34603-34853 + | dan_858 | TTAACAGTTGAGACGATGTCGA-TATAC------------------------------------------ATCAAAAATTGTGTAAGTAATAAGAATACATTATTTAGTATTATACGATCGTATA-ATACAATCATACGTTTTAATATTTTTCCAGAACGTAGCTTTATACGAATATGTGCCACGTCGTGGTCGCTGCGCCCC---GGGAGCCCTACGCGGACGGGCCCCGAGGACAGGCCCCG---ATAGCGCCCCG---CGGACGGGCCCCGGGAGAGCAAGGTGAACGGGCCCCGGGACGT |
| droBip1 | scf7180000396529:4806-5063 + | TTTGAAGCTGGGAGATCGTCGGATATCGATAAAAAAGAAAATATAAAAAAATGCCATATAAATTTTTTATATAAACAATTTAG-------TAAGTATTTATTAAATAAATATTTTGAATAATAATAAATAATTAATAAATCTT-TC-TTTTTTTGGAAACTAGTTTT-----------TGTGATGAAACAGGCGTCGCCTCCCGGAGGGAGCTCC--------------GGAGGAGGAGAGTCGGCAAAAAAGCCCGGACGAAAAGCGGCTTCGGCTG------------CTACTCCAGGGAGT | |
| droKik1 | scf7180000302684:1295930-1295985 - | TATA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATCGTGTA-ATGAAATAAAAAGCTTTAATACATTTTCAAACTGTATCTTTA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| dm3 | chrU:2654670-2654738 + | TATA---------------------------------------------------------------------------------ATTTAAAAAAATTGATTATTTAATAATATACGATTATATT-TTATT-------GATTTAATTTTATTTAAAAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | |
| droPer2 | scaffold_70:98707-98727 - | GGTG-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AACAGGTCTCGGAACGT | |
| droWil2 | scf2_1100000004887:46425-46468 - | TTGG--------------------------------------------------------------------------------------------------------CAACATACGATCATAAC-ATACGATCATACGCGCTAACATT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| Species | Read alignment | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| droAna3 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droBip1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droKik1 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| dm3 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droPer2 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| droWil2 |
|
Generated: 05/17/2015 at 11:25 PM