ID:dan_2848 |
Coordinate:scaffold_13340:1482384-1482534 - |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -18.0 | -17.8 | -17.8 |
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exon [dana_GLEANR_18667:1]; CDS [Dana\GF17402-cds]; intron [Dana\GF17402-in]; Antisense to intron [Dana\GF17582-in]
| Name | Class | Family | Strand |
| AT_rich | Low_complexity | Low_complexity | + |
| AT_rich | Low_complexity | Low_complexity | + |
| ##################################################--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- CTGCATCTCCAGATGGCTGAAGACACGCCAGGTCTGCCCTCTGGATAACCGTGAGTGGGTGTTCCAAAAATATGGCCACTAGGGACAACTCTGCCTTTGGATTTTTATACACAAAAATTTTGATAACACAAATTTTATAAAAATAAAAATTTTACCGAAATAACAAATATGTGTTTTCTTTCCAAAAAAAAAAAAAATAAATAAAGGTATATGAAAAATTCCTAACCGACTTAAAACTGACATATTTTTAA **************************************************...(((((.(((.........))).)))))((((.((....)))))).((((((((((......(((.((((......)))).)))......))))))))))....((((..(((....)))..)))).......................************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | V105 male body |
M044 female body |
V106 head |
V055 head |
M058 embryo |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............GCTGAAGACACGCCAGGTCTG....................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 35.00 | 35 | 29 | 1 | 2 | 3 | 0 |
| ...............................GTCTGCCCTCTGGATAACCGT....................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 33.00 | 33 | 31 | 1 | 0 | 1 | 0 |
| .........................................TGGATAACCGTGAGTGGGTGT............................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 27.00 | 27 | 25 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| .......TCCAGATGGCTGAAGACACGC............................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 27.00 | 27 | 22 | 0 | 3 | 2 | 0 |
| .............................................TAACCGTGAGTGGGTGTTCCA......................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 25.00 | 25 | 23 | 0 | 1 | 1 | 0 |
| ................................................................CAAAAATATGGCCACTAGGGA...................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 23.00 | 23 | 21 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| .......................................TCTGGATAACCGTGAGTGGGT............................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 23.00 | 23 | 22 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .....................................................................ATATGGCCACTAGGGACAACT................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 23.00 | 23 | 17 | 1 | 5 | 0 | 0 |
| .........CAGATGGCTGAAGACACGC............................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 14.00 | 14 | 11 | 0 | 2 | 1 | 0 |
| ................CTGAAGACACGCCAGGTCTG....................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 11.00 | 11 | 11 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................AAAATATGGCCACTAGGGACA.................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 10.00 | 10 | 9 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ......................................................................TATGGCCACTAGGGACAACTC................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 5 | 0 | 2 | 1 | 0 |
| .......................................................................ATGGCCACTAGGGACAACTCT............................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 4 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| ............................................ATAACCGTGAGTGGGTGTTCC.......................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 7 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CTGGATAACCGTGAGTGGGTG.............................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................CTGGATAACCGTGAGTGGG................................................................................................................................................................................................ | 19 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 4 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ........CCAGATGGCTGAAGACACGCC.............................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................CACTAGGGACAACTCTGCCTT.......................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................AAAAATATGGCCACTAGGGA...................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................TGGATAACCGTGAGTGGGTG.............................................................................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..............................................................................CTAGGGACAACTCTGCCTTTG........................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 0 | 4 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................GGATAACCGTGAGTGGGTGTT............................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........CCAGATGGCTGAAGACACGC............................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................AAACTATGCCGACTAGGGA...................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 16 | 3.81 | 61 | 17 | 34 | 1 | 9 | 0 |
| .................................CTGCCCTCTGGATAACCGTG...................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| .......................................................................ATGGCCACTAGGGACAACTC................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 1 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| .................................CTGCCCTCTGGATAACCGTGA..................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................TAGGGACAACTCTGCCTTTGG....................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........CCAGATGGCTGAAGACACG................................................................................................................................................................................................................................ | 19 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................ACACGCCAGGTCTGCCCTCTG................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| ..................GAAGACACGCCAGGTCTGCCC.................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................GTCTGCCCTCTGGATAACCG........................................................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ......................................................GTGGGTGTTCCAAAAATATGG................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................AGGGACAACTCTGCCTTTGGA...................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ....................AGACACGCCAGGTCTGCCCTC.................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
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| ...........................................GATAACCGTGAGTGGGTGTTC........................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...............GCTGAAGACACACCAGGTCTG....................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ....................................CCTTCTGGCTAACCTTGAGT................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 6 | 1.33 | 8 | 0 | 5 | 0 | 3 | 0 |
| .......TCCAGATGGCTGAAGACACG................................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .........AAGATGGCTGAAGACACGCCA............................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
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| ...............GCTTAAGACACGCCAGGTCTG....................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .................TGAAGACACGCCAGGTCTGCC..................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
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| ...............GCTGAAGACACGCCAGGTC......................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..............................................AACCGTGAGTGGGTGTTCCAA........................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........GCAGATGGCTGAAGACACGC............................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................ATATGGCCACTAGGGACAATT................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................GGCCACTAGGGACAACTCTGCCTTTGG....................................................................................................................................................... | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...............................GTCTGCCCTCTGGATAACCGTT...................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............GCTCAAGACACGCAAGGTCTG....................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................TCTGGATAACCGTGAGTGGGG............................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......CTCCAGATGGCTGAAGACAC................................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................................................................CCACTAGGGACAACTCTGC............................................................................................................................................................. | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..................................................................AAACTATGCCGACTAGGGAC..................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................AATAGGGCCACGAGGGAC..................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ...............................................................CCAAAAATATGGCCAATAGGGT...................................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................TGGATAACCGTGAGTGGG................................................................................................................................................................................................ | 18 | 0 | 2 | 0.50 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....ATCTCCAGATGGCTGAAGAT................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 2 | 0.50 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............GCTGAAGACCCACCAGGTAT........................................................................................................................................................................................................................ | 20 | 3 | 10 | 0.40 | 4 | 0 | 0 | 4 | 0 | 0 |
| ................................TCTGCCATCTGGATAAGCGGG...................................................................................................................................................................................................... | 21 | 3 | 3 | 0.33 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ....................................CCTTCTGGCTAACCTTGAG.................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 20 | 0.25 | 5 | 0 | 0 | 0 | 5 | 0 |
| .....................................................................ATATGGCCACTAGGGAAAAAA................................................................................................................................................................. | 21 | 3 | 4 | 0.25 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................TGCCTTCTGGCTAACCTTGA..................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 9 | 0.22 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 |
| .....................................CCTCTGGCTAACCTTGAGTC.................................................................................................................................................................................................. | 20 | 3 | 7 | 0.14 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
| ..................................................................AAACTATGGCGACTAGGGAT..................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 8 | 0.13 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................TTCCCTCTGGCTAACCTTGA..................................................................................................................................................................................................... | 20 | 3 | 9 | 0.11 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................GTTCCCTCTGGATAAACGT....................................................................................................................................................................................................... | 19 | 3 | 10 | 0.10 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ..............................................................................................................................................................................TTTCTTTCCATAAAAAAA........................................................... | 18 | 1 | 19 | 0.05 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 |
|
GACGTAGAGGTCTACCGACTTCTGTGCGGTCCAGACGGGAGACCTATTGGCACTCACCCACAAGGTTTTTATACCGGTGATCCCTGTTGAGACGGAAACCTAAAAATATGTGTTTTTAAAACTATTGTGTTTAAAATATTTTTATTTTTAAAATGGCTTTATTGTTTATACACAAAAGAAAGGTTTTTTTTTTTTTTATTTATTTCCATATACTTTTTAAGGATTGGCTGAATTTTGACTGTATAAAAATT
**************************************************...(((((.(((.........))).)))))((((.((....)))))).((((((((((......(((.((((......)))).)))......))))))))))....((((..(((....)))..)))).......................************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | V105 male body |
V106 head |
M044 female body |
V055 head |
M058 embryo |
V039 embryo |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GACGTAGAGGTCTACCGACTT...................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 29.00 | 29 | 28 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................CCGGTGATCCCTGTTGAGACG............................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 20.00 | 20 | 14 | 4 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| ........................................................................................GAGACGGAAACCTAAAAATAT.............................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 16.00 | 16 | 16 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................TCCCTGTTGAGACGGAAACCT...................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 16.00 | 16 | 16 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................ACCGGTGATCCCTGTTGAGAC.............................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 15.00 | 15 | 13 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................................GTTGAGACGGAAACCTAAAAA................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 12.00 | 12 | 12 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................................................TGTTGAGACGGAAACCTAAAA.................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 11.00 | 11 | 11 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................CCTGTTGAGACGGAAACCTAA.................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 8.00 | 8 | 8 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..........................................................................................GACGGAAACCTAAAAATATGT............................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 5 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................GGCACTCACCCACAAGGTTTT...................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 7.00 | 7 | 5 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................................................CCCTGTTGAGACGGAAACCTA..................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 6.00 | 6 | 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................TGTGCGGTCCAGACGGGAGAC................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 3 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................................TGAGACGGAAACCTAAAAATA............................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 5.00 | 5 | 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................GGGAGACCTATTGGCACTC.................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................CTGTGCGGTCCAGACGGGAG.................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................CTGTTGAGACGGAAACCTAAA................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 4.00 | 4 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................CACTCACCCACAAGGTTTTTA.................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| .........................................................................................AGACGGAAACCTAAAAATATG............................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| GACGTAGAGGTCTACCGACT....................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ....................TCTGTGCGGTCCAGACGGGAG.................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................ACGGGAGACCTATTGGCACTC.................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................TGCGGTCCAGACGGGAGACCT.............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................................GCACTCACCCACAAGGTTTTT..................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................CGGAAACCTAAAAATATGTG........................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................CGGGAGACCTATTGGCACTCA................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................TTGGCACTCACCCACAAGGTT........................................................................................................................................................................................ | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 0 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................AGACGGGAGACCTATTGGCAC...................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 3.00 | 3 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ............................................................................................CGGAAACCTAAAAATATGTGT.......................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| ..................................ACGGGAGACCTATTGGCAC...................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................TCACCCACAAGGTTTTTATAC................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .......................................................................TACCGGTGATCCCTGTTGAGA............................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ...............................CAGACGGGAGACCTATTGGC........................................................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| ...........................................................................................ACGGAAACCTAAAAATATGTG........................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................................................ATCCCTGTTGAGACGGAAACC....................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................CCGGTGATCCCTGTTGAGAC.............................................................................................................................................................. | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| .................................GACGGGAGACCTATTGGCACT..................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................TTCTGTGCGGTCCAGACGGGA................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................TGCGGTCCAGACGGGAGACC............................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GTCCAGACGGGAGACCTATT........................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| .................................GACGGGAGACCTATTGGCAC...................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................GTCCAGACGGGAGACCTATTG.......................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 2.00 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................GTCACTCACCCACAAGGTTTT...................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| ...................TTCTGTGCGGTCCAGACGGG.................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................CCCGGTGATCCCTGTTGAGAC.............................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................GTGATCCCTGTTGAGACG............................................................................................................................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................................................CCTATTGAGACGGAAACCTAA.................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .............................................................................................................GTGTTTTTAAAACTATTGTGT......................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................GGTCCAGACGGGAGACCT.............................................................................................................................................................................................................. | 18 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................................................................TTGTGTTTAAAATATTTTTAT.......................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................ACCGGTGATCCCTGTTGAGACGGAAACC....................................................................................................................................................... | 28 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................................CTCCCCCACAAGTTTTTTAT................................................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| ........................................................................................AAGACGGAAACCTAAAAATAT.............................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ......................ATTGCGGTCCAGACGGGAGACC............................................................................................................................................................................................................... | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................TCCCTGTTGAGACGGAAACC....................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................CGGGAGACCTATTGGCACTC.................................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................CGGGAGACCTATTGGCACT..................................................................................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ..................................ACGGGAGACCTATTGGC........................................................................................................................................................................................................ | 17 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
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| .........................GCGGTCCAGACGTGAGACCTA............................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................CTGTTGAGACGGAGACCTAAA................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................................................................GTGATCCCTGTTGAGACGGAA.......................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................GACGGGATACCTATTGGCAC...................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................GGCACTCACCCACAAGGTTT....................................................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ........................................................................ACCGGTGATCCCTGTTGAGACGGAAAC........................................................................................................................................................ | 27 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................ACTCACCCACAGGGTTTTTA.................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ................................................................................TCACTGTTGAGACGGAAACC....................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| GACGTAGAGGTCTACCTACT....................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................CCGGTGATCTCTGTTGAGACG............................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................ATTTGTGCGGTCCAGACGGGAG.................................................................................................................................................................................................................. | 22 | 2 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................CTGTTGAGACGGAAACCTAA.................................................................................................................................................... | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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| .................................AACGGGAGACCTATTGGCACTC.................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| GACGTAGTGGTCTACCGACTT...................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..............................................................................................................AGTTTTTAAAACTATTGTGTT........................................................................................................................ | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................CAGACGGGAGACCTATTGGCA....................................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................CTGTGCGGTCCAGACGGGAGA................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................TCTGCGCGGTCCAGACGGGAG.................................................................................................................................................................................................................. | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .........................................................................................AGACGGAAACCTAAAAATA............................................................................................................................................... | 19 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ...............................................TGGCACTCACCCACAAGGTTT....................................................................................................................................................................................... | 21 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...................................................................................CTGTTGAGAAGGAAACCTAAA................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ............................CTCCAGACGGGAGACCTATTG.......................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ..................................................GACTCACCCACAAGGTTTTTAT................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .................................AACGGGAGACCTATTGGCAC...................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ...........................GGTCCAGACGGGAGACCTAT............................................................................................................................................................................................................ | 20 | 0 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ....................................AGGAGACCTATTGGCACTC.................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................................................TTTACCGGTGATCCCTGTTGAGA............................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| GACGTCGAGGTCTACCGACTT...................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| ....................TTTGTGCGGTCCAGACGGGA................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1 | 1.00 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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Generated: 05/18/2015 at 05:39 AM