ID:dps_1591 |
Coordinate:4_group3:6326788-6326938 + |
Confidence:Candidate |
Type:Unknown |
[View on UCSC Genome Browser {Cornell Mirror}] |
| Legend: | mature | star | mismatch in alignment | mismatch in read |
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| -15.3 | -15.3 | -15.1 |
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exon [dpse_GLEANR_2574:3]; CDS [Dpse\GA25998-cds]; intron [Dpse\GA25998-in]
No Repeatable elements found
| mature | star |
| ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------################################################## ATGATGGTTACATCATTAAAATTGCCAAAAATCGGCCTCATTTTCGACGTCGAGATTCTGATGCAGTTTGATTCTCTGGATCCCCACGATCCTGGGAGACTTGGTCCTGCACCGATCTGGCCCTATCTGAAATATAGCCTTCCGAAGATTGGCATATTATTAAAATACTGTTACTTTATTTAACCCTTCCTTTCATTTTAGCAGATCGCGCACTCCGGTGGATAGGAATACCTTTCGCGTTCCTGTGGTCA ********************************************************************************..((((......))))(((.(((((.....)))))))).(((..(((((((........)))...)))).))).............************************************************************************************* |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M040 female body |
SRR902010 ovaries |
SRR902011 testis |
GSM444067 head |
M022 male body |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| .....................................TCATTTTCGACGTCGAGATTCTGATG............................................................................................................................................................................................ | 26 | 0 | 7 | 0.71 | 5 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 |
| .....................................TCATTTTCGACGTCGAGATTCTGAT............................................................................................................................................................................................. | 25 | 0 | 7 | 0.57 | 4 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 |
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| .............................................................................................................................................................................................CTTTCATTTTAGCAGATCGC.......................................... | 20 | 0 | 3 | 0.33 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
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|
TACTACCAATGTAGTAATTTTAACGGTTTTTAGCCGGAGTAAAAGCTGCAGCTCTAAGACTACGTCAAACTAAGAGACCTAGGGGTGCTAGGACCCTCTGAACCAGGACGTGGCTAGACCGGGATAGACTTTATATCGGAAGGCTTCTAACCGTATAATAATTTTATGACAATGAAATAAATTGGGAAGGAAAGTAAAATCGTCTAGCGCGTGAGGCCACCTATCCTTATGGAAAGCGCAAGGACACCAGT
*************************************************************************************..((((......))))(((.(((((.....)))))))).(((..(((((((........)))...)))).))).............******************************************************************************** |
Read size | # Mismatch | Hit Count | Total Norm | Total | M040 female body |
SRR902010 ovaries |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Species | Coordinate | ID | Alignment |
|---|---|---|---|
| dp5 | 4_group3:6326738-6326988 + | dps_1591 | ATGATGGTTAC-ATC-ATTAAAATT-GCCAAAAATCGGCC-TCATTTTCGACGTC-GAGATTCTG-ATGCAGTTTGATTCTCTGGATCCCCACGATCCTGGGAGACTTGGTCCTGCACCGATCTGGCCCTA----TCTGAAATATAGCCTTCCGAAGATTGGCATATTATTAAAATACTGTTACTTTATTTAACCCTTCCTTTCATTTTAGCAGATCGCGCACTCCGGTGGATAGGAATACCTTTCGCGTTCCTGTGGTCA |
| droPer2 | scaffold_1:7818297-7818554 + | ATGATGGTTAC-ATCAATTAAAATT-GCCAAAAATCGGCCTTCATTTTCGACGTCAGAGATTTTA-ATGCAGTTCGACAGTCTGGATTCTCACGATCCTGGGAGAGTTGGTCCTGCAGCGATGTGACCCTATTTGTCTGAAAAATAGCCTTCCGAAGATTTGCATATTATTAAAATACTGTTACTTTATTTAACCCTTCCTTTCATTTTAGCAGATCGCGCCCTCCGGTGGATAGGAATACCTTTCGCATTCCCGTGGTCA | |
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| Species | Read alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| dp5 |
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| droPer2 |
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| droAna3 |
|
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| droBip1 |
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| droKik1 |
|
Generated: 05/18/2015 at 01:02 AM